特許ウォッチ

公開番号2025016471
公報種別公開特許公報(A)
公開日2025-02-04
出願番号2024173444,2021548675
出願日2024-10-02,2020-02-21
発明の名称CD33抗体とそれを用いた癌を治療する方法
出願人メモリアルスローンケタリングキャンサーセンター
代理人個人,個人,個人,個人,個人,個人
主分類C07K 16/28 20060101AFI20250128BHJP(有機化学)
要約【課題】CDS 3タンパク質と結合し得る免疫グロブリン関連構成物(例えば、抗体またはその抗原結合断片)を提供する。
【解決手段】重鎖免疫グロブリン可変ドメイン(V_H)および軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン(V_L)を含む抗体またはその抗原結合断片であって、
(a)V_Hは、配列番号154のV_H-CDR1配列、配列番号155のV_H-CDR2配列、および配列番号156のV_H-CDR3配列を含み、かつ
(b)V_Lは、配列番号157のV_L-CDR1配列、配列番号158のV_L-CDR2配列、および配列番号159のV_L-CDR3配列を含む、抗体またはその抗原結合断片。
【選択図】なし
特許請求の範囲【請求項１】
重鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
H
）および軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
L
）を含む抗体またはその抗原結合断片であって、
（ａ）Ｖ
H
は、ＧＹＳＦＴＤＹＮ（配列番号１５４）のＶ
H
－ＣＤＲ１配列、ＩＤＰＹＫＧＧＴ（配列番号１５５）のＶ
H
－ＣＤＲ２配列、およびＡＲＥＭＩＴＡＹＹＦＤＹ（配列番号１５６）のＶ
H
－ＣＤＲ３配列を含み、ならびに
（ｂ）Ｖ
L
は、ＱＤＩＮＫＹ（配列番号１５７）のＶ
L
－ＣＤＲ１配列、ＹＡＳ（配列番号１５８）のＶ
L
－ＣＤＲ２配列、およびＬＱＹＤＮＬＬＴ（配列番号１５９）Ｖ
L
－ＣＤＲ３配列を含む、抗体またはその抗原結合断片。
続きを表示（約 1,600 文字）【請求項２】
重鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
H
）および軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
L
）を含む抗体またはその抗原結合断片であって、
（ａ）Ｖ
H
は、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、および配列番号１３３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、ならびに／または
（ｂ）Ｖ
L
は、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、および配列番号１３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合断片。
【請求項３】
ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＭ、ＩｇＤおよびＩｇＥからなる群から選択されるアイソタイプのＦｃドメインをさらに含む、請求項１または２に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項４】
Ｎ２９７ＡおよびＫ３２２Ａからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸置換を含むＩｇＧ１定常領域を含む、請求項３に記載の抗体。
【請求項５】
Ｓ２２８Ｐ変異を含むＩｇＧ４定常領域を含む、請求項３に記載の抗体。
【請求項６】
Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）
2
、Ｆａｂ’、ｓｃＦ
v
およびＦ
v
からなる群から選択される、請求項１または２に記載の抗原結合断片。
【請求項７】
ＣＤ３３のＩｇＣ２ドメインと結合する、請求項１～６のいずれか１項に記載の抗体または抗原結合断片。
【請求項８】
モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体または二重特異性抗体である、請求項１～５または７のいずれか１項に記載の抗体。
【請求項９】
配列番号１６、配列番号２０、配列番号２２、配列番号１３６、配列番号１３９、配列番号１４１、もしくは１つもしくは複数の保存的アミノ酸置換を有するその変種を含む重鎖（ＨＣ）アミノ酸配列、ならびに／または配列番号１４、配列番号１８、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号１３４、配列番号１３８、配列番号１４０、もしくは１つもしくは複数の保存的アミノ酸置換を有するその変種を含む軽鎖（ＬＣ）アミノ酸配列を含む抗体。
【請求項１０】
それぞれ、
配列番号１６および配列番号１４（ｃｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；
配列番号２０および配列番号１８（ＢＣ２４９－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；
配列番号１３６および配列番号１３４（ＢＣ２７５－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；
配列番号２２および配列番号１８（ＢＣ２６７－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；
配列番号２２および配列番号２４（ＢＣ２６８－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；
配列番号２０および配列番号２６（ＶＬ３ＶＨ５ｘｍＣ８２５）；
配列番号２０および配列番号２７（ＶＬ３ＶＨ５ｘｈＣ８２５）；
配列番号２２および配列番号２６（ＶＬ３ＶＨ６ｘｍＣ８２５）；
配列番号２２および配列番号２７（ＶＬ３ＶＨ６ｘｈＣ８２５）；
配列番号２２および配列番号２８（ＶＬ４ＶＨ６ｘｍＣ８２５）；
配列番号２２および配列番号２９（ＶＬ４ＶＨ６ｘｈＣ８２５）、
配列番号１３９および配列番号１３８（マウスＶＬ－マウスＶＨ×ｍＣ８２５）；ならびに
配列番号１４１および配列番号１４０（マウスＶＬ－マウスＶＨ×ｈＣ８２５）
からなる群から選択されるＨＣアミノ酸配列およびＬＣアミノ酸配列を含む、請求項９に記載の抗体。
（【請求項１１】以降は省略されています）
発明の詳細な説明【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１９年２月２２日に出願された米国仮特許出願第６２／８０９，０９１号の利益および優先権を主張し、全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
本技術は、概して、ＣＤ３３タンパク質と特異的に結合する、免疫グロブリン関連構成物（例えば、抗体またはその抗原結合断片）の調製およびその使用に関する。特に、本技術は、ＣＤ３３結合抗体の調製ならびにＣＤ３３関連癌およびアルツハイマー病の検出および治療におけるその使用に関する。
続きを表示（約 5,700 文字）【背景技術】
【０００２】
本技術の背景技術の以下の説明は、本技術の理解における補助として単に提供され、本技術の先行技術を説明するまたは構成すると認めるものではない。
急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）は、小児白血病の２５％を占めるが、小児白血病による死亡者数の半数以上を占める。８０％以上の小児が治癒可能な急性リンパ性白血病とは対照的に、小児ＡＭＬは小児癌の中で５年生存率が最も低い。成人の６０歳以前に診断された患者では、ＡＭＬは３５～４０％の症例で治癒可能であるが、６０歳以後に発症した患者では５～１５％しか治癒できない（Dohner et al., N Engl J Med 373:1136-52 (2015)）。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００３】
本開示は、概して、ＣＤ３３ポリペプチドと特異的に結合し得る免疫グロブリン関連構成物（例えば、抗体またはその抗原結合断片）を提供する。
【課題を解決するための手段】
【０００４】
一態様では、本開示は、重鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
H
）および軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
L
）を含む抗体またはその抗原結合断片であって、（ａ）Ｖ
H
は、ＧＹＳＦＴＤＹＮ（配列番号１５４）のＶ
H
－ＣＤＲ１配列、ＩＤＰＹＫＧＧＴ（配列番号１５５）のＶ
H
－ＣＤＲ２配列およびＡＲＥＭＩＴＡＹＹＦＤＹ（配列番号１５６）のＶ
H
－ＣＤＲ３配列を含み、ならびに（ｂ）Ｖ
L
は、ＱＤＩＮＫＹ（配列番号１５７）のＶ
L
－ＣＤＲ１配列、ＹＡＳ（配列番号１５８）のＶ
L
－ＣＤＲ２配列およびＬＱＹＤＮＬＬＴ（配列番号１５９）のＶ
L
－ＣＤＲ３配列を含む、抗体またはその抗原結合断片を提供する。
一態様では、本開示は、重鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
H
）および軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン（Ｖ
L
）を含む抗体またはその抗原結合断片であって、（ａ）Ｖ
H
は、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、および配列番号１３３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、ならびに／または（ｂ）Ｖ
L
は、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、および配列番号１３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、抗体またはその抗原結合断片を提供する。
【０００５】
上記の実施形態のいずれかでは、抗体は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＭ、ＩｇＤおよびＩｇＥからなる群から選択されるアイソタイプのＦｃドメインをさらに含み得る。いくつかの実施形態では、抗体は、Ｎ２９７ＡおよびＫ３２２Ａからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸置換を含むＩｇＧ１定常領域を含む。さらにまたはあるいは、いくつかの実施形態では、抗体は、Ｓ２２８Ｐ変異を含むＩｇＧ４定常領域を含む。特定の実施形態では、抗原結合断片は、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）
2
、Ｆａｂ’、ｓｃＦ
v
およびＦ
v
からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、抗体は、モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体または二重特異性抗体である。特定の実施形態では、抗体または抗原結合断片は、ＣＤ３３のＩｇＣ２ドメインと結合する。
別の態様では、本開示は、配列番号１６、配列番号２０、配列番号２２、配列番号１３６、配列番号１３９、配列番号１４１、もしくは１つもしくは複数の保存的アミノ酸置換を有するその変種を含む重鎖（ＨＣ）アミノ酸配列および／または配列番号１４、配列番号１８、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号１３４、配列番号１３８、配列番号１４０、もしくは１つもしくは複数の保存的アミノ酸置換を有するその変種を含む軽鎖（ＬＣ）アミノ酸配列を含む抗体を提供する。特定の実施形態では、抗体は、それぞれ、配列番号１６および配列番号１４（ｃｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；配列番号２０および配列番号１８（ＢＣ２４９－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；配列番号１３６および配列番号１３４（ＢＣ２７５－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；配列番号２２および配列番号１８（ＢＣ２６７－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；配列番号２２および配列番号２４（ＢＣ２６８－ｈＨＩＭ３４ｘＣＤ３ＢｓＡｂ）；配列番号２０および配列番号２６（ＶＬ３ＶＨ５ｘｍＣ８２５）；配列番号２０および配列番号２７（ＶＬ３ＶＨ５ｘｈＣ８２５）；配列番号２２および配列番号２６（ＶＬ３ＶＨ６ｘｍＣ８２５）；配列番号２２および配列番号２７（ＶＬ３ＶＨ６ｘｈＣ８２５）；配列番号２２および配列番号２８（ＶＬ４ＶＨ６ｘｍＣ８２５）；配列番号２２および配列番号２９（ＶＬ４ＶＨ６×ｈＣ８２５）、配列番号１３９および配列番号１３８（マウスＶＬ－マウスＶＨ×ｍＣ８２５）；ならびに配列番号１４１および配列番号１４０（マウスＶＬ－マウスＶＨ×ｈＣ８２５）からなる群から選択されるＨＣアミノ酸配列およびＬＣアミノ酸配列を含む。
【０００６】
一態様では、本開示は、（ａ）配列番号９、１０、１１、１２もしくは１３のうちいずれか１つ中に存在する軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％または少なくとも９９％同一である軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン配列および／または（ｂ）配列番号２、３、４、５、６、７もしくは１３３のうちいずれか１つ中に存在する重鎖免疫グロブリン可変ドメイン配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％または少なくとも９９％同一である重鎖免疫グロブリン可変ドメイン配列を含む抗体を提供する。
別の態様では、本開示は、（ａ）配列番号１４、１８、２４、２６、２７、２８、２９、１３４、１３８もしくは１４０のうちいずれか１つ中に存在するＬＣ配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％もしくは少なくとも９９％同一であるＬＣ配列および／または（ｂ）配列番号１６、２０、２２、１３６、１３９もしくは１４１のうちいずれか１つ中に存在するＨＣ配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％もしくは少なくとも９９％同一であるＨＣ配列を含む抗体を提供する。
【０００７】
上記実施形態のいずれにおいても、抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体または二重特異性抗体である。さらにまたはあるいは、いくつかの実施形態では、抗体はＮ２９７ＡおよびＫ３２２Ａからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸置換を含むＩｇＧ１定常領域を含む。特定の実施形態では、本技術の抗体はＳ２２８Ｐ変異を含むＩｇＧ４定常領域を含む。上記の実施形態のいずれかでは、抗体はＣＤ３３のＩｇＣ２ドメインと結合する。さらにまたはあるいは、いくつかの実施形態では、本技術の抗体はα－１，６－フコース修飾を欠く。
一態様では、本開示は、配列番号３０～１１３または１４２～１５３のいずれか１つから選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、二重特異性抗体または抗原結合断片を提供する。特定の実施形態では、前記二重特異性抗体または抗原結合断片は、配列番号３０～１１３または１４２～１５３は、のいずれか１つから選択されるアミノ酸配列を含む。
【０００８】
一態様では、本開示は、第１のポリペプチド鎖を含む二重特異性抗原結合断片であって、第１のポリペプチド鎖は、Ｎ末端からＣ末端に向かって、（ｉ）第１のエピトープと特異的に結合可能な第１の免疫グロブリンの重鎖可変ドメイン、（ｉｉ）アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
6
を含む可動性ペプチドリンカー、（ｉｉｉ）第１の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメイン、（ｉｖ）アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
4
を含む可動性ペプチドリンカー、（ｖ）第２のエピトープと特異的に結合可能な第２の免疫グロブリンの重鎖可変ドメイン、（ｖｉ）アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
6
を含む可動性ペプチドリンカー、（ｖｉｉ）第２の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメイン、（ｖｉｉｉ）アミノ酸配列ＴＰＬＧＤＴＴＨＴ含む可動性ペプチドリンカー配列、および（ｉｘ）自己集合脱集合（ＳＡＤＡ）ポリペプチドを含み、第１の免疫グロブリンの重鎖可変ドメインは、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、および配列番号１３３からなる群から選択され、ならびに／または、第１の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメインは、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、および配列番号１３からなる群から選択される、二重特異性抗原結合断片を提供する。
【０００９】
別の態様では、本開示は、第１のポリペプチド鎖を含む二重特異性抗原結合断片であって、第１のポリペプチド鎖は、Ｎ末端からＣ末端に向かって、（ｉ）第１のエピトープと特異的に結合可能な第１の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメイン、（ｉｉ）アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
6
を含む可動性ペプチドリンカー、（ｉｉｉ）第１の免疫グロブリンの重鎖可変ドメイン、（ｉｖ）アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
4
を含む可動性ペプチドリンカー、（ｖ）第２のエピトープと特異的に結合可能な第２の免疫グロブリンの重鎖可変ドメイン、（ｖｉ）アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
6
を含む可動性ペプチドリンカー、（ｖｉｉ）第２の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメイン、（ｖｉｉｉ）アミノ酸配列ＴＰＬＧＤＴＴＨＴ含む可動性ペプチドリンカー配列、および（ｉｘ）自己集合脱集合（ＳＡＤＡ）ポリペプチドを含み、第１の免疫グロブリンの重鎖可変ドメインは、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、および配列番号１３３からなる群から選択され、ならびに／または、第１の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメインは、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、および配列番号１３からなる群から選択される、二重特異性抗原結合断片を提供する。本明細書において開示される二重特異性抗原結合断片の特定の実施形態では、ＳＡＤＡポリペプチドは、四量体化、五量体化、または六量体化ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＳＡＤＡポリペプチドは、ｐ５３、ｐ６３、ｐ７３、ｈｎＲＮＰＣ、ＳＮＡ－２３、ステフィンＢ、ＫＣＮＱ４、およびＣＢＦＡ２Ｔ１のいずれか１種の四量体化ドメインを含む。さらにまたはあるいは、いくつかの実施形態では、二重特異性抗原結合断片は、配列番号３０～１１３または１４２～１５３から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００１０】
一態様では、本開示は、第１のポリペプチド鎖、第２のポリペプチド鎖、第３のポリペプチド鎖、および第４のポリペプチド鎖を含む二重特異性抗体であって、第１および第２のポリペプチド鎖は互いに共有結合し、第２および第３のポリペプチド鎖は互いに共有結合し、第３および第４のポリペプチド鎖は互いに共有結合し、（ａ）第１のポリペプチド鎖と第４のポリペプチド鎖のそれぞれは、Ｎ末端からＣ末端に向かって、（ｉ）第１のエピトープと特異的に結合可能な第１の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメイン、（ｉｉ）第１の免疫グロブリンの軽鎖定常ドメイン、（ｉｉｉ）アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
3
を含む可動性ペプチドリンカー、および（ｉｖ）第２の免疫グロブリンの相補的な重鎖可変ドメインに連結された第２の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメイン、または第２の免疫グロブリンの相補的な軽鎖可変ドメインに連結された第２の免疫グロブリンの重鎖可変ドメインであって、第２の免疫グロブリンの軽鎖および重鎖可変ドメインは、第２のエピトープと特異的に結合可能であり、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）
6
を含む可動性ペプチドリンカーを介して互いに連結されて一本鎖可変断片を形成している、第２の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメインまたは重鎖可変ドメインを含み、ならびに（ｂ）第２のポリペプチド鎖と第３のポリペプチド鎖のそれぞれは、Ｎ末端からＣ末端に向かって（ｉ）第１のエピトープと特異的に結合可能な第１の免疫グロブリンの重鎖可変ドメイン、および（ｉｉ）第１の免疫グロブリンの重鎖定常ドメインを含み、第１の免疫グロブリンの重鎖可変ドメインは、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、および配列番号１３３からなる群から選択され、ならびに／または、第１の免疫グロブリンの軽鎖可変ドメインは、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、および配列番号１３からなる群から選択される、二重特異性抗体を提供する。特定の実施形態では、第２の免疫グロブリンは、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ２０、ＣＤ１９、ＣＤ２１、ＣＤ２３、ＣＤ４６、ＣＤ８０、ＨＬＡ－ＤＲ、ＣＤ７４、ＣＤ２２、ＣＤ１４、ＣＤ１５、ＣＤ１６、ＣＤ１２３、ＴＣＲガンマ／デルタ、ＮＫｐ４６、ＫＩＲまたは小分子ＤＯＴＡハプテンと結合する。
（【００１１】以降は省略されています）

関連特許