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公開番号2024029237
公報種別公開特許公報(A)
公開日2024-03-05
出願番号2024003468,2022155422
出願日2024-01-12,2015-06-16
発明の名称胃がんの検出キット又はデバイス及び検出方法
出願人東レ株式会社,国立研究開発法人国立がん研究センター
代理人弁理士法人平木国際特許事務所
主分類C12Q 1/6886 20180101AFI20240227BHJP(生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学)
要約【課題】胃がんの検出用キット又はデバイス、並びに、検出方法の提供
【解決手段】被験体の検体中のmiRNAと特異的に結合可能な核酸を含む、胃がん検出用キット又はデバイス、並びに、該miRNAをin vitroで測定することを含む、胃がんを検出する方法。
【選択図】なし
特許請求の範囲【請求項1】
胃がんマーカーであるmiR-6088のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、胃がんの検出用キット。
続きを表示(約 10,000 文字)【請求項2】
miR-6088がhsa-miR-6088である、請求項1に記載のキット。
【請求項3】
前記核酸が、下記の(a)~(d)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項1又は2に記載のキット:
(a)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(b)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、及び
(d)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド。
【請求項4】
前記キットが、別の胃がんマーカーである、miR-6726-5p、miR-1343-3p、miR-1247-3p、miR-6787-5p、miR-6875-5p、miR-1225-3p、miR-8063、miR-6781-5p、miR-4746-3p、miR-1908-5p、miR-6756-5p、miR-204-3p、miR-4651、miR-6757-5p、miR-6825-5p、miR-7108-5p、miR-4792、miR-7641、miR-3188、miR-3131、miR-6780b-5p、miR-8069、miR-6840-3p、miR-8072、miR-1233-5p、miR-6887-5p、miR-1231、miR-5572、miR-6738-5p、miR-6784-5p、miR-6791-5p、miR-6749-5p、miR-6741-5p、miR-128-1-5p、miR-4419b、miR-6746-5p、miR-3184-5p、miR-3679-5p、miR-7110-5p、miR-4516、miR-6717-5p、miR-6826-5p、miR-4433b-3p、miR-3679-3p、miR-3135b、miR-3622a-5p、miR-711、miR-4467、miR-6857-5p、miR-6515-3p、miR-1225-5p、miR-187-5p、miR-3185、miR-642b-3p、miR-1249、miR-744-5p、miR-4442、miR-1228-3p、miR-939-5p、miR-6845-5p、miR-887-3p、miR-7845-5p、miR-6729-5p、miR-4632-5p、miR-615-5p、miR-6724-5p、miR-4728-5p、miR-6732-5p、miR-6816-5p、miR-4695-5p、miR-7975、miR-3197、miR-6125、miR-4433-3p、miR-6727-5p、miR-4706、miR-7847-3p、miR-6805-3p、miR-6766-3p、miR-1913、miR-4649-5p、miR-602、miR-3663-3p、miR-6893-5p、miR-6861-5p、miR-4449、miR-6842-5p、miR-4454、miR-5195-3p、miR-663b、miR-6765-5p、miR-4513、miR-614、miR-6785-5p、miR-6777-5p、miR-940、miR-4741、miR-6870-5p、miR-6131、miR-150-3p、miR-4707-5p、miR-1915-3p、miR-3937、miR-937-5p、miR-4443、miR-1914-3p、miR-3620-5p、miR-1268b、miR-1227-5p、miR-6880-5p、miR-4417、miR-6802-5p、miR-6769a-5p、miR-663a、miR-6721-5p、miR-4532、miR-7977、miR-92b-5p、miR-371a-5p、miR-6126、miR-4734、miR-4665-3p、miR-423-5p、miR-1469、miR-4675、miR-6716-5p、miR-718、miR-4281、miR-6820-5p、miR-6795-5p、miR-6779-5p、miR-7109-5p、miR-6798-5p、miR-4648、miR-8059、miR-6765-3p、miR-6132、miR-4492、miR-7107-5p、miR-3195、miR-3180、miR-296-3p、miR-564、miR-1268a、miR-6848-5p、miR-762、miR-2861、miR-1203、miR-1260b、miR-4476、miR-6885-5p、miR-6769b-5p、miR-23b-3p、miR-1343-5p、miR-3621、miR-4688、miR-4286、miR-4640-5p、miR-4739、miR-1260a、miR-4276、miR-7106-5p、miR-6794-5p、miR-6774-5p、miR-4707-3p、miR-4534、miR-4294、miR-6850-5p、miR-6089、miR-671-5p、miR-128-2-5p、miR-125a-3p、miR-92a-2-5p及びmiR-486-3pからなる群、及び/又は、miR-3196、miR-211-3p、miR-4271、miR-6851-5p、miR-149-3p、miR-4667-5p、miR-135a-3p、miR-4486、miR-4697-5p、miR-4725-3p、miR-6510-5p、miR-5001-5p、miR-4673、miR-4466、miR-23a-3p、miR-3656、miR-6782-5p、miR-4689、miR-451a、miR-4446-3p、miR-3180-3p、miR-642a-3p、miR-6889-5p、miR-3178、miR-4665-5p、miR-6722-3p、miR-30c-1-3p、miR-4507、miR-3141及びmiR-1199-5pからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項1~3のいずれか1項に記載のキット。
【請求項5】
miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6875-5pがhsa-miR-6875-5pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-1233-5pがhsa-miR-1233-5pであり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-3679-3pがhsa-miR-3679-3pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6857-5pがhsa-miR-6857-5pであり、miR-6515-3pがhsa-miR-6515-3pであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-1249がhsa-miR-1249であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-1228-3pがhsa-miR-1228-3pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6805-3pがhsa-miR-6805-3pであり、miR-6766-3pがhsa-miR-6766-3pであり、miR-1913がhsa-miR-1913であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-602がhsa-miR-602であり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-4449がhsa-miR-4449であり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-940がhsa-miR-940であり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6131がhsa-miR-6131であり、miR-150-3pがhsa-miR-150-3pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-937-5pがhsa-miR-937-5pであり、miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-3620-5pがhsa-miR-3620-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-6802-5pがhsa-miR-6802-5pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6721-5pがhsa-miR-6721-5pであり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-4734がhsa-miR-4734であり、miR-4665-3pがhsa-miR-4665-3pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-6716-5pがhsa-miR-6716-5pであり、miR-718がhsa-miR-718であり、miR-4281がhsa-miR-4281であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pであり、miR-7109-5pがhsa-miR-7109-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-8059がhsa-miR-8059であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-7107-5pがhsa-miR-7107-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-564がhsa-miR-564であり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-6848-5pがhsa-miR-6848-5pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-2861がhsa-miR-2861であり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-1260bがhsa-miR-1260bであり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6769b-5pがhsa-miR-6769b-5pであり、miR-23b-3pがhsa-miR-23b-3pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-3621がhsa-miR-3621であり、miR-4688がhsa-miR-4688であり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-4640-5pがhsa-miR-4640-5pであり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-4276がhsa-miR-4276であり、miR-7106-5pがhsa-miR-7106-5pであり、miR-6794-5pがhsa-miR-6794-5pであり、miR-6774-5pがhsa-miR-6774-5pであり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-6850-5pがhsa-miR-6850-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-4271がhsa-miR-4271であり、miR-6851-5pがhsa-miR-6851-5pであり、miR-149-3pがhsa-miR-149-3pであり、mi
R-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-135a-3pがhsa-miR-135a-3pであり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4697-5pがhsa-miR-4697-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-6510-5pがhsa-miR-6510-5pであり、miR-5001-5pがhsa-miR-5001-5pであり、miR-4673がhsa-miR-4673であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-23a-3pがhsa-miR-23a-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-3180-3pがhsa-miR-3180-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-4665-5pがhsa-miR-4665-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4507がhsa-miR-4507であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、及び、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pである、請求項4に記載のキット。
【請求項6】
前記核酸が、下記の(e)~(l)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項4又は5に記載のキット:
(e)配列番号2~71、73~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(f)配列番号2~71、73~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(g)配列番号2~71、73~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(h)配列番号2~71、73~127、129~165、635~642、及び166~169のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(i)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(j)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(k)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、及び
(l)配列番号170~199のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド。
【請求項7】
請求項1~6のいずれか1項に記載のキットを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が胃がんに罹患していること、又は胃がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、胃がんの検出を補助する方法。
【請求項8】
胃がんマーカーであるmiR-6088のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、胃がんの検出用デバイスを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が胃がんに罹患していること、又は胃がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、胃がんの検出を補助する方法。
【請求項9】
miR-6088がhsa-miR-6088である、請求項8に記載の方法。
【請求項10】
前記核酸が、下記の(a)~(d)に示すポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項8又は9に記載の方法:
(a)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(b)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、及び
(d)配列番号72で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド。
(【請求項11】以降は省略されています)

発明の詳細な説明【技術分野】
【0001】
本発明は、被験体において胃がんへの罹患の有無の検査のために使用される、特定のmiRNAと特異的に結合可能な核酸を含む胃がんの検出用キット又はデバイス、及び当該核酸を用いて当該miRNAの発現量を測定することを含む胃がんの検出方法に関する。
続きを表示(約 1,800 文字)【背景技術】
【0002】
胃は食道につながる袋状の消化器官で、食道から入ってきた食物をいったん貯め、胃液分泌して消化の最初の段階を担う役割を果たす。胃は、食道につながる入口付近が噴門部、十二指腸につながる出口付近が幽門部、それ以外の部位が胃体部に分けられる(非特許文献1)。国立研究開発法人国立がん研究センターがん対策情報センターが開示する本国内における部位別のがん罹患および死亡数の統計によると、胃がんの罹患者は2010年、男性86,728人、女性39,002人の計125,730人と推定される。また胃がんによる2012年の死亡数は男性32,206人、女性16,923人の計49,129人であり、日本のがんによる死因の第2位となっている。また、米国では、2014年に22,220人が胃がんに罹患し、10,990人が胃がんによって死亡すると推測されている(非特許文献1)。
【0003】
胃がんの進行度は非特許文献2に定められており、腫瘍の大きさ、浸潤性、リンパ節転移、遠隔転移などによってステージ0、IA、IB、IIA、IIB、IIIA、IIIB、IIIC、IVに分類される。胃がんの5年相対生存率はがんの進行度に大きく依存し、ステージIでは57~71%、ステージIIでは33~46%、ステージIIIでは9~20%、ステージIVでは4%と報告されている(非特許文献1)。従って、胃がんを早期に発見することは生存率の向上につながるため、早期発見を可能にする手段の提供が強く切望されている。
【0004】
胃がんの治療には外科療法、薬物療法や放射線療法が併用される。特に、ごく早期のリンパ節転移の疑いがない胃がんでは、内視鏡的粘膜切除術(Endoscopic Mucosal Resection, EMR)や内視鏡的粘膜下層剥離術(Endoscopic Submucosal Dissection, ESD)が適応可能な場合が多くあり、患者に負担をかけることなく治療することが可能である。
【0005】
胃がんの早期発見を目指して、日本では40才以上の男女に、年1回の胃がん検診が推奨されている。胃がん検診の方法として「胃X線検査」の有効性が示されており、X線検査の結果、精密検査が必要とされた場合には、胃内視鏡検査が実施される。このほか、胃がんの発見のためには、CT、PET、MRIなどの画像診断も利用されている(非特許文献1)。
【0006】
一方、胃がんのスクリーニングのための血液マーカーは確立されていない。血清中のCEAおよびCA19-9などのタンパク質腫瘍マーカーが胃がんと関連することが示唆されているが(非特許文献3)、スクリーニング用途として使用することを推奨する十分なエビデンスは存在しない。また一方、研究段階ではあるが、特許文献1~3に示されるように、血液をはじめとする生体サンプル中のマイクロRNA(miRNA)の発現量、又はmiRNAの発現量と他のタンパク質マーカーの発現量とを組み合わせることによって、胃がんを検出するという報告がある。
【0007】
特許文献1には血液中のhsa-miR-125a-3pを用いて胃がんを含むがんを検出する方法が示されている。
【0008】
特許文献2には血液や組織中のhsa-miR-23a-3p、miR-92-1、miR-92-2(miR-92a-1-3p、miR-92a-2-3p)並びに、miR-128b(miR-128-2-3p)、miR-30c(miR-30c-5p)、miR-135-1、miR-135-2(miR-135a-5p)及びmiR-149(miR-149-5p)その他のmiRNAを用いて、胃がんを検出する方法が示されている。
【0009】
特許文献3には血液中のhsa-miR-451および468(hsa-miR-468-5p)を用いて胃がんを検出する方法が示されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0010】
国際公開第2010/062706号
特開2014-060993号公報
特開2013-085542号公報
【非特許文献】
(【0011】以降は省略されています)

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