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公開番号2025016525
公報種別公開特許公報(A)
公開日2025-02-04
出願番号2024180795,2023015526
出願日2024-10-16,2017-12-22
発明の名称RAF(急速進行性線維肉腫)ポリペプチドの標的分解のための化合物および方法
出願人アルビナス・オペレーションズ・インコーポレイテッド,ARVINAS OPERATIONS, INC.,エール・ユニバーシティ,YALE UNIVERSITY
代理人弁理士法人深見特許事務所
主分類C07D 401/14 20060101AFI20250128BHJP(有機化学)
要約【課題】RAF(急速進行性線維肉腫(Rapidly Accelerated Fibrosarcoma)、c-RAF、A-RAFおよび/またはB-RAFなど;標的タンパク質)の調節因子としての有用性を見出す二官能性化合物を提供する。
【解決手段】本開示は、標的タンパク質の分解(および阻害)をもたらすために標的タンパク質がユビキチンリガーゼに近接して配置されるように、一方の末端にフォンヒッペル-リンドウ、セレブロン、アポトーシス阻害タンパク質またはそれぞれのE3ユビキチンリガーゼに結合されるMDM2(mouse double-minute homolog 2)リガンドを含有し、他方の末端に標的タンパク質RAFを結合する部分を含む二官能性化合物を対象とする。
【選択図】なし
特許請求の範囲【請求項１】
化学構造：
ＵＬＭ－Ｌ－ＰＴＭ
を有する二官能性化合物、またはその薬学的に許容可能な塩、鏡像異性体、立体異性体、溶媒和物、多形体もしくはプロドラッグであって、
式中、
前記ＵＬＭは、Ｅ３ユビキチンリガーゼに結合する低分子Ｅ３ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
前記ＰＴＭは、ＲＡＦ（ｒａｐｉｄｌｙａｃｃｅｌｅｒａｔｅｄｆｉｂｒｏｓａｒｃｏｍａ）タンパク質標的化部分を含む低分子であり、
前記Ｌは、ＵＬＭとＰＴＭとを結合する結合部分または化学結合部分である、二官能性
化合物。
続きを表示（約 7,600 文字）【請求項２】
前記Ｅ３ユビキチンリガーゼ結合部分が、フォンヒッペル－リンドウ（ＶＬＭ）、セレブロン（ＣＬＭ）、ＭＤＭ２（ｍｏｕｓｅｄｏｕｂｌｅ－ｍｉｎｕｔｅｈｏｍｏｌｏｇ２）（ＭＬＭ）、およびＩＡＰ（ＩＬＭ）から成る群から選択されるＥ３ユビキチンリガーゼを標的とする、請求項１に記載の二官能性化合物。
【請求項３】
前記ＰＴＭが化学構造ＰＴＭ－ＩａまたはＰＴＭ－Ｉｂによって表され、
TIFF
2025016525000957.tif
75
117
TIFF
2025016525000958.tif
63
114
式中、
二重破線の結合は芳香族結合であり、
Ｖ
ＰＴＭ
、Ｗ
ＰＴＭ
、Ｘ
ＰＴＭ
、Ｙ
ＰＴＭ
、Ｚ
ＰＴＭ
は、以下の組み合わせ：Ｃ、ＣＨ、Ｎ、Ｎ、Ｃ；Ｃ、Ｎ、Ｎ、ＣＨ、Ｃ；Ｃ、Ｏ、Ｃ、ＣＨ、Ｃ；Ｃ、Ｓ、Ｃ、ＣＨ、Ｃ；Ｃ、ＣＨ、Ｃ、Ｏ、Ｃ；Ｃ、ＣＨ、Ｃ、Ｓ、Ｃ；Ｃ、ＣＨ、Ｎ、ＣＨ、Ｃ；Ｎ、ＣＨ、Ｃ、ＣＨ、Ｃ；Ｃ、ＣＨ、Ｃ、ＣＨ、Ｎ；Ｎ、Ｎ、Ｃ、ＣＨ、Ｃ；Ｎ、ＣＨ、Ｃ、Ｎ、Ｃ；Ｃ、ＣＨ、Ｃ、Ｎ、Ｎ；Ｃ、Ｎ、Ｃ、ＣＨ、Ｎ；Ｃ、Ｎ、Ｃ、Ｎ、Ｃ；およびＣ、Ｎ、Ｎ、Ｎ、Ｃのうちの１つであり、
Ｘ
ＰＴＭ３５
、Ｘ
ＰＴＭ３６
、Ｘ
ＰＴＭ３７
、およびＸ
ＰＴＭ３８
は、ＣＨおよびＮから独立して選択され、
Ｒ
ＰＴＭ１
は、ＵＬＭ、化学リンカー基（Ｌ）、ＣＬＭ、ＩＬＭ、ＶＬＭ、ＭＬＭ、ＵＬＭ’、ＣＬＭ’、ＩＬＭ’、ＶＬＭ’、ＭＬＭ’、またはその組み合わせに共有結合され、
Ｒ
ＰＴＭ２
は、水素、ハロゲン、アリール、メチル、エチル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、かつＭ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）であり、
Ｒ
ＰＴＭ３
は、不在、水素、アリール、メチル、エチル、その他のアルキル、環状アルキル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、かつＭ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）であり、
Ｒ
ＰＴＭ４
は、水素、ハロゲン、アリール、メチル、エチル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、かつＭ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）であり、
Ｒ
ＰＴＭ５
は、
TIFF
2025016525000959.tif
120
155
から成る群から選択される、請求項１または２に記載の二官能性化合物。
【請求項４】
前記ＰＴＭが化学構造ＰＴＭ－ＩＩａまたはＰＴＭ－ＩＩｂによって表され、
TIFF
2025016525000960.tif
70
143
TIFF
2025016525000961.tif
68
129
式中、
Ｘ
ＰＴＭ１
、Ｘ
ＰＴＭ２
、Ｘ
ＰＴＭ３
、Ｘ
ＰＴＭ４
、Ｘ
ＰＴＭ５
、およびＸ
ＰＴＭ６
はＣＨまたはＮから独立して選択され、
Ｒ
ＰＴＭ５
は、Ｈ、任意で置換されるアミド（例えば、アルキル基、メチル基、エチル基、プロピル基、またはブチル基で任意で置換される）、任意で置換されるアミン、
TIFF
2025016525000962.tif
25
114
、
－ＮＨＣ（Ｏ）Ｒ
ＰＴＭ５
から成る群から選択され、
Ｒ
ＰＴＭ５
は、
TIFF
2025016525000963.tif
120
155
から成る群から選択され、
Ｒ
ＰＴＭ６ａ
およびＲ
ＰＴＭ６ｂ
はそれぞれ水素、ハロゲン、またはＣ
１
－Ｃ
６
アルキル（直鎖、分枝鎖、任意で置換される）から独立して選択され、
Ｒ
ＰＴＭ６
は、不在、水素、ハロゲン、アリール、メチル、エチル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、Ｍ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）の群のうちいずれかであり、
Ｒ
ＰＴＭ７
は、不在、水素、ハロゲン、アリール、メチル、エチル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、Ｍ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）であり、
Ｒ
ＰＴＭ８
、Ｒ
ＰＴＭ９
またはＲ
ＰＴＭ１０
は、不在、水素、ハロゲン、アリール、ヘテロアリール、アルキル、シクロアルキル、複素環、メチル、エチル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、Ｍ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）から成る群から独立して選択され、
Ｒ
ＰＴＭ１１
は、不在、水素、ハロゲン、メチル、エチル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
【請求項５】
Ｒ
ＰＴＭ９
が前記共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ７
およびＲ
ＰＴＭ８
は、Ｒ
ＰＴＭ７
およびＲ
ＰＴＭ８
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合される、または
Ｒ
ＰＴＭ８
が共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ９
およびＲ
ＰＴＭ１０
は、Ｒ
ＰＴＭ９
およびＲ
ＰＴＭ１０
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合される、または
ＲＰＴＭ１０が共有結合位置であるとき、ＲＰＴＭ８およびＲＰＴＭ９は、ＲＰＴＭ８およびＲＰＴＭ９が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合される、請求項４に記載の二官能性化合物。
【請求項６】
前記ＰＴＭが化学構造ＰＴＭ－ＩＩＩによって表され、
TIFF
2025016525000964.tif
73
159
式中、
Ｘ
ＰＴＭ７
、Ｘ
ＰＴＭ８
、Ｘ
ＰＴＭ９
、Ｘ
ＰＴＭ１０
、Ｘ
ＰＴＭ１１
、Ｘ
ＰＴＭ１２
、Ｘ
ＰＴＭ１３
、Ｘ
ＰＴＭ１４
、Ｘ
ＰＴＭ１５
、Ｘ
ＰＴＭ１６
、Ｘ
ＰＴＭ１７
、Ｘ
ＰＴＭ１８
、Ｘ
ＰＴＭ１９
、Ｘ
ＰＴＭ２０
は、独立してＣＨまたはＮであり、
Ｒ
ＰＴＭ１２
、Ｒ
ＰＴＭ１３
、Ｒ
ＰＴＭ１４
、Ｒ
ＰＴＭ１５
、Ｒ
ＰＴＭ１６
、Ｒ
ＰＴＭ１７
、Ｒ
ＰＴＭ１８
、Ｒ
ＰＴＭ１９
は、不在、水素、ハロゲン、アリール、ヘテロアリール、シクロアルキル、複素環、メチル、エチル、その他のアルキル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、Ｍ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）から成る群から独立して選択され、
Ｒ
ＰＴＭ２０
は、４つ未満の非水素原子を含有する小さな基であり、
Ｒ
ＰＴＭ２１
は、トリフルオロメチル、クロロ、ブロモ、フルオロ、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ｔｅｒｔ－ブチル、ブチル、ｉｓｏ－ブチル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
、ジメチルアミノまたはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯまたはＮＨであり、Ｍ２は水素、アルキル、環状アルキル、アリールまたは複素環である）から成る群から選択され、
Ｒ
ＰＴＭ１２
、Ｒ
ＰＴＭ１３
およびＲ
ＰＴＭ１６
のうち少なくとも１つは、ＵＬＭ、化学リンカー基（Ｌ）、ＣＬＭ、ＩＬＭ、ＶＬＭ、ＭＬＭ、ＵＬＭ’、ＣＬＭ’、ＩＬＭ’、ＶＬＭ’、ＭＬＭ’、またはその組み合わせに共有結合されるように修飾される、請求項１または２に記載の二官能性化合物。
【請求項７】
Ｒ
ＰＴＭ１２
が共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ１３
およびＲ
ＰＴＭ１４
は、Ｒ
ＰＴＭ１３
およびＲ
ＰＴＭ１４
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合され、かつ／もしくはＲ
ＰＴＭ１５
およびＲ
ＰＴＭ１６
は、Ｒ
ＰＴＭ１５
およびＲ
ＰＴＭ１６
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合される、
Ｒ
ＰＴＭ１３
が共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ１２
およびＲ
ＰＴＭ１６
は、Ｒ
ＰＴＭ１２
およびＲ
ＰＴＭ１６
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合され、かつ／もしくはＲ
ＰＴＭ１５
およびＲ
ＰＴＭ１６
は、Ｒ
ＰＴＭ１５
およびＲ
ＰＴＭ１６
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合される、または
Ｒ
ＰＴＭ１６
が共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ１２
およびＲ
ＰＴＭ１３
は、Ｒ
ＰＴＭ１２
およびＲ
ＰＴＭ１３
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合され、および／もしくはＲ
ＰＴＭ１３
およびＲ
ＰＴＭ１４
は、Ｒ
ＰＴＭ１３
およびＲ
ＰＴＭ１４
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合される、請求項６に記載の化合物。
【請求項８】
前記ＰＴＭが化学構造ＰＴＭ－ＩＶａまたはＰＴＭ－ＩＶｂによって表され、
TIFF
2025016525000965.tif
106
139
TIFF
2025016525000966.tif
106
126
式中、
Ｘ
ＰＴＭ２１
、Ｘ
ＰＴＭ２２
、Ｘ
ＰＴＭ２３
、Ｘ
ＰＴＭ２４
、Ｘ
ＰＴＭ２５
、Ｘ
ＰＴＭ２６
、Ｘ
ＰＴＭ２７
、Ｘ
ＰＴＭ２８
、Ｘ
ＰＴＭ２９
、Ｘ
ＰＴＭ３０
、Ｘ
ＰＴＭ３１
、Ｘ
ＰＴＭ３２
、Ｘ
ＰＴＭ３３
、Ｘ
ＰＴＭ３４
は、独立してＣＨまたはＮであり、
Ｒ
ＰＴＭ２２
は、
TIFF
2025016525000967.tif
120
155
から成る群から選択され、
Ｒ
ＰＴＭ２５ａ
およびＲ
ＰＴＭ２５ｂ
は、それぞれ水素、ハロゲン、またはＣ
１
－Ｃ
６
アルキル（直鎖、分枝鎖、任意で置換される）から独立して選択され、
Ｒ
ＰＴＭ２３
、Ｒ
ＰＴＭ２４
、Ｒ
ＰＴＭ２８
、Ｒ
ＰＴＭ２９
、Ｒ
ＰＴＭ３０
、Ｒ
ＰＴＭ３１
、Ｒ
ＰＴＭ３２
は、不在、結合、水素、ハロゲン、アリール（任意で置換される）、ヘテロアリール（任意で置換される）、シクロアルキル（任意で置換される）、複素環（任意で置換される）、メチル、エチル（任意で置換される）、その他のアルキル（直鎖、分枝鎖、任意で置換される）、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＭ１－ＣＨ
２
－ＣＨ
２
－Ｍ２（式中、Ｍ１はＣＨ
２
、ＯおよびＮＨであり、Ｍ２は水素、アルキル（直鎖、分枝鎖、任意で置換される）、環状アルキル（任意で置換される）、アリール（任意で置換される）または複素環（任意で置換される））から成る群から独立して選択され、
Ｒ
ＰＴＭ２５
は不在、水素、ハロゲン、Ｃ
１
－Ｃ
６
アルキル（直鎖、分枝鎖、任意で置換される）、ＯＣＨ
３
、ＮＨＣＨ
３
またはＳＣＨ
３
から選択され、
Ｒ
ＰＴＭ２６
は不在、水素、ハロゲン、Ｃ
１
－Ｃ
６
アルキル（直鎖、分枝鎖、任意で置換される）、ＯＣＨ３、ＮＨＣＨ
【請求項９】
Ｒ
ＰＴＭ２４
が前記共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ３１
およびＲ
ＰＴＭ３２
は、Ｒ
ＰＴＭ３１
およびＲ
ＰＴＭ３２
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合され、またはＲ
ＰＴＭ２９
およびＲ
ＰＴＭ３０
は、Ｒ
ＰＴＭ２９
およびＲ
ＰＴＭ３０
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に
共有結合を介して結合され、または
Ｒ
ＰＴＭ２９
が共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ２４
およびＲ
ＰＴＭ３２
は、Ｒ
ＰＴＭ２４
およびＲ
ＰＴＭ３２
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合され、および／またはＲ
ＰＴＭ３１
およびＲ
ＰＴＭ３２
は、Ｒ
ＰＴＭ３１
およびＲ
ＰＴＭ３２
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合され、または
Ｒ
ＰＴＭ３２
が共有結合位置であるとき、Ｒ
ＰＴＭ２４
およびＲ
ＰＴＭ２９
は、Ｒ
ＰＴＭ２４
およびＲ
ＰＴＭ２９
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合され、および／またはＲ
ＰＴＭ２９
およびＲ
ＰＴＭ３０
は、Ｒ
ＰＴＭ２９
およびＲ
ＰＴＭ３０
が付着する環を有する二環式基を形成するようなやり方で、共に共有結合を介して結合される、請求項８に記載の二官能性化合物。
【請求項１０】
前記ＰＴＭが、ＰＴＭ－１、ＰＴＭ－２、ＰＴＭ－３、ＰＴＭ－４、ＰＴＭ－５、ＰＴＭ－６、ＰＴＭ－７、およびＰＴＭ－８：
TIFF
2025016525000968.tif
190
156
TIFF
2025016525000969.tif
48
137
から成る群から選択される、請求項１～１０のいずれか一項に記載の二官能性化合物。
（【請求項１１】以降は省略されています）
発明の詳細な説明【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本開示は、２０１６年１２月２３日に出願された米国仮出願第６２／４３８，８０３号、および２０１７年１１月７日に出願された米国仮出願第６２／５８２，６９８号に対する優先権を主張するものであり、どちらも参照により本その全体が明細書に組み込まれる。
参照による組み込み
２０１６年８月５日に出願された米国特許出願第１５／２３０，３５４号と、２０１６年７月１１日に出願された米国特許出願第１５／２０６，４９７号と、２０１６年７月１３日に出願された米国特許出願第１５／２０９，６４８号と、２０１６年１０月１１日に出願された米国特許出願第６２／４０６，８８８号と、２０１５年４月１４日に出願され、米国特許出願公開第２０１５／０２９１５６２号として公開された米国特許出願第１４／６８６，６４０号と、２０１５年７月６日に出願され、米国特許出願公開第２０１６／００５８８７２号として公開された米国特許出願第１４／７９２，４１４号と、２０１４年７月１１日に出願され、米国特許出願公開第２０１４／０３５６３２２号として公開された米国特許出願第１４／３７１，９５６号と、２０１６年３月１８日に出願され、米国特許出願公開第２０１６／０２７２６３９号として公開された米国特許出願第１５／０７４，８２０号と、は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。さらに、本明細書に引用されるすべての参照文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
連邦政府による資金提供を受けた研究に関する記載
本発明は、米国国立衛生研究所により発行された助成金番号ＮＩＨＲ３５ＣＡ１９７５８９に基づく政府支援のもとなされたものである。政府は本発明において特定の権利を有する。
続きを表示（約 3,800 文字）【０００２】
本明細書は、標的タンパク質結合部分およびＥ３ユビキチンリガーゼ結合部分を含む二
官能性化合物および関連する使用方法を提供する。当該二官能性化合物は、標的ユビキチン化の調節因子として有用であり、特に、本開示による二官能性化合物によって分解および／または別手段により阻害されるＲＡＦ（ＲａｐｉｄｌｙＡｃｃｅｌｅｒａｔｅｄＦｉｂｒｏｓａｒｃｏｍａ）タンパク質に関して有用である。
【背景技術】
【０００３】
ほとんどの低分子薬剤は、酵素または受容体に密接に、および明確に定められたポケットにおいて結合する。一方で低分子化合物を使用してタンパク質－タンパク質相互作用を標的とすることは困難であることが良く知られており、その理由は、タンパク質の接触表面が大きいこと、および関与するのが浅い溝状または平坦なインターフェースであるためである。Ｅ３ユビキチンリガーゼ（そのうちの数百がヒトにおいて公知である）は、ユビキチン化に基質特異性を与える。ゆえに、特定のタンパク質基質に対する特異性があり、汎用的なプロテアソームの阻害剤よりもさらに魅力的な治療標的である。Ｅ３リガーゼのリガンドの開発は、タンパク質－タンパク質相互作用を破壊せざるを得ないという事実があるために部分的には困難であることが判明している。しかしながら近年の開発により、これらのリガーゼに結合する特定のリガンドが提供された。例えば、最初の低分子Ｅ３リガーゼ阻害剤であるナトリンの発見以来、Ｅ３リガーゼを標的とするさらなる化合物が報告されているが、未だこの分野は未開発である部分が多い。例えば、最初の低分子Ｅ３リガーゼであるＭＤＭ２（ｍｏｕｓｅｄｏｕｂｌｅｍｉｎｕｔｅ２ｈｏｍｏｌｏｇ）阻害剤であるナトリンの発見以来、ＭＤＭ２（すなわち、ｈｕｍａｎｄｏｕｂｌｅｍｉｎｕｔｅ２（ＨＤＭ２））Ｅ３リガーゼを標的とするさらなる化合物が報告されている（Ｊ．Ｄｉ，ｅｔａｌ．ＣｕｒｒｅｎｔＣａｎｃｅｒＤｒｕｇＴａｒｇｅｔｓ（２０１１），１１（８），９８７－９９４）。
【０００４】
腫瘍抑制遺伝子のｐ５３は、ＤＮＡ損傷またはストレスに応じた細胞増殖の停止およびアポトーシスに重要な役割を果たしており（Ａ．Ｖａｚｑｕｅｚ，ｅｔａｌ．Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ．Ｄｉｓ．（２００８），７，９７９－９８２）、ｐ５３の不活化が腫瘍細胞生存の重要な経路の１つとして提唱されている（Ａ．Ｊ．Ｌｅｖｉｎｅ，ｅｔａｌ．Ｎａｔｕｒｅ（２０００），４０８，３０７－３１０）。癌患者においてｐ５３の突然変異が約５０％で発見されており（Ｍ．Ｈｏｌｌｓｔｅｉｎ，ｅｔａｌ．Ｓｃｉｅｎｃｅ（１９９１），２３３，４９－５３）、一方で野生型のｐ５３を有する患者は、ｐ５３とＭＤＭ２とのタンパク質－タンパク質相互作用を通した、ＭＤＭ２によるｐ５３の下方制御が多く発見されている（Ｐ．Ｃｈｅｎｅ，ｅｔａｌ．Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｃａｎｃｅｒ（２００３），３，１０２－１０９）。発癌性ストレスシグナルが無い正常な細胞の状態では、ＭＤＭ２はｐ５３を低濃度で保持している。ＤＮＡ損傷や細胞ストレスに応じてｐ５３のレベルは上昇し、さらにｐ５３／ＭＤＭ２のオート制御システムからのフィードバックループにより、ＭＤＭ２の上昇も生じる。言い換えれば、ｐ５３は転写レベルでＭＤＭ２を制御し、ＭＤＭ２はその活性レベルでｐ５３を制御する（Ａ．Ｊ．Ｌｅｖｉｎｅ，ｅｔａｌ．ＧｅｎｅｓＤｅｖ．（１９９３）７，１１２６－１１３２）。
【０００５】
幾つかの機序により、ＭＤＭ２によるｐ５３の下方制御を説明することができる。まず最初にＭＤＭ２はｐ５３のＮ末端ドメインに結合し、ｐ５３応答性遺伝子の発現を阻害する（Ｊ．Ｍｏｍａｎｄ，ｅｔａｌ．Ｃｅｌｌ（１９９２），６９，１２３７－１２４５）。次いでＭＤＭ２はｐ５３を核から細胞質へと往復させ、タンパク溶解性の分解を促進する（Ｊ．Ｒｏｔｈ，ｅｔａｌ．ＥＭＢＯＪ．（１９９８），１７，５５４－５６４）。最後にＭＤＭ２は、内在的なＥ３リガーゼ活性を有しており、ｐ５３にユビキチンを結合させ、ユビキチン依存性２６ｓプロテアソーム系（ＵＰＳ）を通して分解させる（Ｙ．Ｈａｕｐｔ，ｅｔａｌ．Ｎａｔｕｒｅ（１９９７）３８７，２９６－２９９）。ＭＤＭ２はＥ３リガーゼとして機能することから、ＭＤＭ２を疾患原因となるタンパク質へとリクルートさせ、そのユビキチン化と分解の活性を発揮させることは、非常に興味深い薬
剤開発手法である。
【０００６】
魅力的な治療可能性のあるＥ３リガーゼの１つが、フォンヒッペル－リンドウ（ｖｏｎ
Ｈｉｐｐｅｌ－Ｌｉｎｄａｕ（ＶＨＬ））腫瘍抑制因子であり、これはＥ３リガーゼ複合体ＶＣＢの基質認識サブユニットであり、この複合体はさらにエロンギン（ｅｌｏｎｇｉｎ）ＢおよびＣ、Ｃｕｌ２ならびにＲｂｘ１から成る。ＶＨＬの主な基質は、低酸素誘導因子１α（ＨＩＦ－１α）であり、これは低酸素レベルに対応して、血管新生成長因子のＶＥＧＦ、および赤血球誘導型サイトカインのエリスロポエチンなどの遺伝子を上方制御する転写因子である。Ｅ３リガーゼの基質認識サブユニットに対するフォンヒッペル－リンドウ（ＶＨＬ）の最初の低分子リガンドが作製され、結晶構造が取得され、この化合物がＶＨＬの主要基質である転写因子ＨＩＦ－１αの結合様式を模倣することが確認された。
【０００７】
セレブロンは、ヒトにおいてＣＲＢＮ遺伝子によりコードされるタンパク質である。ＣＲＢＮのオルソログは、植物からヒトまで高度に保存されており、このことはその生理学的な重要性を明確に示すものである。セレブロンは、損傷を受けたＤＮＡ結合タンパク質１（ＤＤＢ１）、カリン（Ｃｕｌｌｉｎ）－４Ａ（ＣＵＬ４Ａ）、およびカリン１（Ｃｕｌｌｉｎｓ１）調節因子（ＲＯＣ１）とのＥ３ユビキチンリガーゼ複合体を形成する。この複合体は多数の他のタンパク質をユビキチン化する。完全には解明されていない機序を介して、標的タンパク質のセレブロンユビキチン化は、線維芽細胞成長因子８（ＦＧＦ８）および線維芽細胞成長因子１０（ＦＧＦ１０）のレベル増加をもたらす。ＦＧＦ８は次に、例えば四肢および耳胞の形成などの多数の開発プロセスを制御する。胚においてこのユビキチンリガーゼ複合体は四肢成長に重要であると最終的に結論づけられている。セレブロンが不在の状況下において、ＤＤＢ１はＤＤＢ２と複合体を形成し、ＤＮＡ損傷結合タンパク質として機能する。
【０００８】
アポトーシス阻害タンパク質（ＩＡＰ：ＩｎｈｉｂｉｔｏｒｏｆＡｐｏｐｔｏｓｉｓＰｒｏｔｅｉｎｓ）はアポトーシスの抑制、すなわち細胞死に関与するタンパク質ファミリーである。ヒトのＩＡＰファミリーには８つの構成因子が含まれ、多くの他の生命体もＩＡＰホモログを含有する。ＩＡＰはＥ３リガーゼ特異的ドメインとバキュロウイルスＩＡＰリピート（ＢＩＲ：ｂａｃｕｌｏｖｉｒａｌＩＡＰｒｅｐｅａｔ）ドメインを含有し、これらが基質を認識し、そのユビキチン化を促進する。ＩＡＰはユビキチン化を促進し、そしてカスパーゼに直接結合し、これを阻害することができる。カスパーゼは、アポトーシスを実行するプロテアーゼである（例えば、カスパーゼ－３、カスパーゼ－７、およびカスパーゼ－９）。ゆえに、カスパーゼの結合を通して、ＩＡＰは細胞死を阻害する。しかしアポトーシス促進性の刺激はミトコンドリアタンパク質のＤＩＡＢＬＯ（ｓｅｃｏｎｄｍｉｔｒｏｃｈｏｎｄｒｉａ－ｄｅｒｉｖｅｄａｃｔｉｖａｔｏｒｏｆｃａｓｐａｓｅｓ、またはＳＭＡＣとしても知られる）およびＨＴＲＡ２（Ｏｍｉとしても知られる）の放出を生じさせる。ＤＩＡＢＬＯとＨＴＲＡ２の結合は、ＩＡＰ活性を阻害すると考えられている。
【０００９】
ＳＭＡＣは、ＸＩＡＰ、ｃ－ＩＡＰ１、ｃ－ＩＡＰ２、ＮＩＬ－ＩＡＰ、Ｂｒｕｃｅ、およびサバイビンを含む本質的にすべての公知のＩＡＰと相互作用する。成熟型ＳＭＡＣの最初の４つのアミノ酸（ＡＶＰＩ）がＩＡＰの一部分に結合する。これがＩＡＰの抗アポトーシス効果の阻害に必須であると考えられている。
【００１０】
米国特許出願公開第２０１５－０２９１５６２号および同第２０１４－０３５６３２２号（参照により本明細書に組み込まれる）に記載されるものなどの二官能性化合物が内因性タンパク質をＥ３ユビキチンリガーゼへとリクルートし、分解するように機能する。特に当該特許公開は、二官能性またはタンパク溶解性の標的化キメラ（ＰＲＯＴＡＣ：ｐｒ
ｏｔｅｏｌｙｓｉｓｔａｒｇｅｔｉｎｇｃｈｉｍｅｒｉｃ）化合物を記載しており、当該化合物は様々なポリペプチドおよび他のタンパク質の標的ユビキチン化の調節因子としての有用性が見いだされ、それらは当該二官能性化合物によって分解および／または別手段により阻害される。
（【００１１】以降は省略されています）

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