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公開番号2025020145
公報種別公開特許公報(A)
公開日2025-02-12
出願番号2024178808,2023123893
出願日2024-10-11,2018-09-17
発明の名称変異型P53を認識するT細胞受容体
出願人個人
代理人個人,個人,個人,個人,個人,個人,個人,個人
主分類C07K 14/705 20060101AFI20250204BHJP(有機化学)
要約【課題】がんの更なる治療法を提供する。
【解決手段】G245S変異を有するヒトp53に対して抗原特異性を有する、単離又は精製されたT細胞受容体(TCR)、関連するポリペプチド及びタンパク質、並びに関連する核酸、組み換え発現ベクター、宿主細胞、細胞の集団、及び医薬組成物も提供される。また、哺乳類におけるがんの存在を検出する方法及び哺乳類におけるがんを治療又は予防する方法も開示される。
【選択図】図1
特許請求の範囲【請求項１】
変異型ヒトｐ５３に対して抗原特異性を有する、単離又は精製されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）。
続きを表示（約 10,000 文字）【請求項２】
配列番号１の１７５位、２２０位、２４５位、又は２４８位に変異を有するヒトｐ５３に対して抗原特異性を有する、請求項１に記載のＴＣＲ。
【請求項３】
以下のヒトｐ５３変異：Ｒ１７５Ｈ、Ｙ２２０Ｃ、Ｇ２４５Ｓ、Ｒ２４８Ｑ、又はＲ２４８Ｗのうちの１つを有するヒトｐ５３に対して抗原特異性を有する、請求項１に記載のＴＣＲ。
【請求項４】
（１）配列番号２７～３２の全て；
（２）配列番号３７～４２の全て；
（３）配列番号４７～５２の全て；
（４）配列番号５７～６２の全て；
（５）配列番号６７～７２の全て；
（６）配列番号７７～８２の全て；
（７）配列番号８７～９２の全て；
（８）配列番号９７～１０２の全て；
（９）配列番号１０７～１１２の全て；
（１０）配列番号１１７～１２２の全て；
（１１）配列番号１２７～１３２の全て；
（１２）配列番号１３７～１４２の全て；
（１３）配列番号１４７～１５２の全て；
（１４）配列番号１５７～１６２の全て；
（１５）配列番号１６７～１７２の全て；
（１６）配列番号１７７～１８２の全て；
（１７）配列番号１８７～１９２の全て；
（１８）配列番号１９７～２０２の全て；
（１９）配列番号２０７～２１２の全て；
（２０）配列番号２１７～２２２の全て；
（２１）配列番号２２７～２３２の全て；
（２２）配列番号２３７～２４２の全て；
（２３）配列番号２４７～２５２の全て；
（２４）配列番号２５７～２６２の全て；
（２５）配列番号２６７～２７２の全て；
（２６）配列番号２７７～２８２の全て；
（２７）配列番号２８７～２９２の全て；
（２８）配列番号２９７～３０２の全て；
（２９）配列番号３０７～３１２の全て；
（３０）配列番号３１７～３２２の全て；
（３１）配列番号３２７～３３２の全て；
（３２）配列番号３３７～３４２の全て；
（３３）配列番号３４７～３５２の全て；
（３４）配列番号３５７～３６２の全て；
（３５）配列番号３６７～３７２の全て；
（３６）配列番号３７７～３８２の全て；
（３７）配列番号３８７～３９２の全て；
（３８）配列番号３９７～４０２の全て；
（３９）配列番号４０７～４１２の全て；
（４０）配列番号４１７～４２２の全て；
（４１）配列番号４２７～４３２の全て；
（４２）配列番号４３７～４４２の全て；
（４３）配列番号４４７～４５２の全て；
（４４）配列番号４５７～４６２の全て；
（４５）配列番号４６７～４７２の全て；
（４６）配列番号４７７～４８２の全て；又は
（４７）配列番号４８７～４９２の全て
のアミノ酸配列を含む、請求項１～３のいずれか一項に記載のＴＣＲ。
【請求項５】
（１）配列番号３３～３４の両方；
（２）配列番号４３～４４の両方；
（３）配列番号５３～５４の両方；
（４）配列番号６３～６４の両方；
（５）配列番号７３～７４の両方；
（６）配列番号８３～８４の両方；
（７）配列番号９３～９４の両方；
（８）配列番号１０３～１０４の両方；
（９）配列番号１１３～１１４の両方；
（１０）配列番号１２３～１２４の両方；
（１１）配列番号１３３～１３４の両方；
（１２）配列番号１４３～１４４の両方；
（１３）配列番号１５３～１５４の両方；
（１４）配列番号１６３～１６４の両方；
（１５）配列番号１７３～１７４の両方；
（１６）配列番号１８３～１８４の両方；
（１７）配列番号１９３～１９４の両方；
（１８）配列番号２０３～２０４の両方；
（１９）配列番号２１３～２１４の両方；
（２０）配列番号２２３～２２４の両方；
（２１）配列番号２３３～２３４の両方；
（２２）配列番号２４３～２４４の両方；
（２３）配列番号２５３～２５４の両方；
（２４）配列番号２６３～２６４の両方；
（２５）配列番号２７３～２７４の両方；
（２６）配列番号２８３～２８４の両方；
（２７）配列番号２９３～２９４の両方；
（２８）配列番号３０３～３０４の両方；
（２９）配列番号３１３～３１４の両方；
（３０）配列番号３２３～３２４の両方；
（３１）配列番号３３３～３３４の両方；
（３２）配列番号３４３～３４４の両方；
（３３）配列番号３５３～３５４の両方；
（３４）配列番号３６３～３６４の両方；
（３５）配列番号３７３～３７４の両方；
（３６）配列番号３８３～３８４の両方；
（３７）配列番号３９３～３９４の両方；
（３８）配列番号４０３～４０４の両方；
（３９）配列番号４１３～４１４の両方；
（４０）配列番号４２３～４２４の両方；
（４１）配列番号４３３～４３４の両方；
（４２）配列番号４４３～４４４の両方；
（４３）配列番号４５３～４５４の両方；
（４４）配列番号４６３～４６４の両方；
（４５）配列番号４７３～４７４の両方；
（４６）配列番号４８３～４８４の両方；又は
（４７）配列番号４９３～４９４の両方
のアミノ酸配列を含む、請求項１～４のいずれか一項に記載のＴＣＲ。
【請求項６】
（１）配列番号３５～３６の両方；
（２）配列番号４５～４６の両方；
（３）配列番号５５～５６の両方；
（４）配列番号６５～６６の両方；
（５）配列番号７５～７６の両方；
（６）配列番号８５～８６の両方；
（７）配列番号９５～９６の両方；
（８）配列番号１０５～１０６の両方；
（９）配列番号１１５～１１６の両方；
（１０）配列番号１２５～１２６の両方；
（１１）配列番号１３５～１３６の両方；
（１２）配列番号１４５～１４６の両方；
（１３）配列番号１５５～１５６の両方；
（１４）配列番号１６５～１６６の両方；
（１５）配列番号１７５～１７６の両方；
（１６）配列番号１８５～１８６の両方；
（１７）配列番号１９５～１９６の両方；
（１８）配列番号２０５～２０６の両方；
（１９）配列番号２１５～２１６の両方；
（２０）配列番号２２５～２２６の両方；
（２１）配列番号２３５～２３６の両方；
（２２）配列番号２４５～２４６の両方；
（２３）配列番号２５５～２５６の両方；
（２４）配列番号２６５～２６６の両方；
（２５）配列番号２７５～２７６の両方；
（２６）配列番号２８５～２８６の両方；
（２７）配列番号２９５～２９６の両方；
（２８）配列番号３０５～３０６の両方；
（２９）配列番号３１５～３１６の両方；
（３０）配列番号３２５～３２６の両方；
（３１）配列番号３３５～３３６の両方；
（３２）配列番号３４５～３４６の両方；
（３３）配列番号３５５～３５６の両方；
（３４）配列番号３６５～３６６の両方；
（３５）配列番号３７５～３７６の両方；
（３６）配列番号３８５～３８６の両方；
（３７）配列番号３９５～３９６の両方；
（３８）配列番号４０５～４０６の両方；
（３９）配列番号４１５～４１６の両方；
（４０）配列番号４２５～４２６の両方；
（４１）配列番号４３５～４３６の両方；
（４２）配列番号４４５～４４６の両方；
（４３）配列番号４５５～４５６の両方；
（４４）配列番号４６５～４６６の両方；
（４５）配列番号４７５～４７６の両方；
（４６）配列番号４８５～４８６の両方；又は
（４７）配列番号４９５～４９６の両方
のアミノ酸配列を含む、請求項１～５のいずれか一項に記載のＴＣＲ。
【請求項７】
請求項１～６のいずれか一項に記載のＴＣＲの機能的部分を含む、単離又は精製されたポリペプチドであって、
（１）配列番号２７～３２の全て；
（２）配列番号３７～４２の全て；
（３）配列番号４７～５２の全て；
（４）配列番号５７～６２の全て；
（５）配列番号６７～７２の全て；
（６）配列番号７７～８２の全て；
（７）配列番号８７～９２の全て；
（８）配列番号９７～１０２の全て；
（９）配列番号１０７～１１２の全て；
（１０）配列番号１１７～１２２の全て；
（１１）配列番号１２７～１３２の全て；
（１２）配列番号１３７～１４２の全て；
（１３）配列番号１４７～１５２の全て；
（１４）配列番号１５７～１６２の全て；
（１５）配列番号１６７～１７２の全て；
（１６）配列番号１７７～１８２の全て；
（１７）配列番号１８７～１９２の全て；
（１８）配列番号１９７～２０２の全て；
（１９）配列番号２０７～２１２の全て；
（２０）配列番号２１７～２２２の全て；
（２１）配列番号２２７～２３２の全て；
（２２）配列番号２３７～２４２の全て；
（２３）配列番号２４７～２５２の全て；
（２４）配列番号２５７～２６２の全て；
（２５）配列番号２６７～２７２の全て；
（２６）配列番号２７７～２８２の全て；
（２７）配列番号２８７～２９２の全て；
（２８）配列番号２９７～３０２の全て；
（２９）配列番号３０７～３１２の全て；
（３０）配列番号３１７～３２２の全て；
（３１）配列番号３２７～３３２の全て；
（３２）配列番号３３７～３４２の全て；
（３３）配列番号３４７～３５２の全て；
（３４）配列番号３５７～３６２の全て；
（３５）配列番号３６７～３７２の全て；
（３６）配列番号３７７～３８２の全て；
（３７）配列番号３８７～３９２の全て；
（３８）配列番号３９７～４０２の全て；
（３９）配列番号４０７～４１２の全て；
（４０）配列番号４１７～４２２の全て；
（４１）配列番号４２７～４３２の全て；
（４２）配列番号４３７～４４２の全て；
（４３）配列番号４４７～４５２の全て；
（４４）配列番号４５７～４６２の全て；
（４５）配列番号４６７～４７２の全て；
（４６）配列番号４７７～４８２の全て；又は
（４７）配列番号４８７～４９２の全て
のアミノ酸配列を含むポリペプチド。
【請求項８】
（１）配列番号３３～３４の両方；
（２）配列番号４３～４４の両方；
（３）配列番号５３～５４の両方；
（４）配列番号６３～６４の両方；
（５）配列番号７３～７４の両方；
（６）配列番号８３～８４の両方；
（７）配列番号９３～９４の両方；
（８）配列番号１０３～１０４の両方；
（９）配列番号１１３～１１４の両方；
（１０）配列番号１２３～１２４の両方；
（１１）配列番号１３３～１３４の両方；
（１２）配列番号１４３～１４４の両方；
（１３）配列番号１５３～１５４の両方；
（１４）配列番号１６３～１６４の両方；
（１５）配列番号１７３～１７４の両方；
（１６）配列番号１８３～１８４の両方；
（１７）配列番号１９３～１９４の両方；
（１８）配列番号２０３～２０４の両方；
（１９）配列番号２１３～２１４の両方；
（２０）配列番号２２３～２２４の両方；
（２１）配列番号２３３～２３４の両方；
（２２）配列番号２４３～２４４の両方；
（２３）配列番号２５３～２５４の両方；
（２４）配列番号２６３～２６４の両方；
（２５）配列番号２７３～２７４の両方；
（２６）配列番号２８３～２８４の両方；
（２７）配列番号２９３～２９４の両方；
（２８）配列番号３０３～３０４の両方；
（２９）配列番号３１３～３１４の両方；
（３０）配列番号３２３～３２４の両方；
（３１）配列番号３３３～３３４の両方；
（３２）配列番号３４３～３４４の両方；
（３３）配列番号３５３～３５４の両方；
（３４）配列番号３６３～３６４の両方；
（３５）配列番号３７３～３７４の両方；
（３６）配列番号３８３～３８４の両方；
（３７）配列番号３９３～３９４の両方；
（３８）配列番号４０３～４０４の両方；
（３９）配列番号４１３～４１４の両方；
（４０）配列番号４２３～４２４の両方；
（４１）配列番号４３３～４３４の両方；
（４２）配列番号４４３～４４４の両方；
（４３）配列番号４５３～４５４の両方；
（４４）配列番号４６３～４６４の両方；
（４５）配列番号４７３～４７４の両方；
（４６）配列番号４８３～４８４の両方；又は
（４７）配列番号４９３～４９４の両方
のアミノ酸配列を含む、請求項７に記載のポリペプチド。
【請求項９】
（１）配列番号３５～３６の両方；
（２）配列番号４５～４６の両方；
（３）配列番号５５～５６の両方；
（４）配列番号６５～６６の両方；
（５）配列番号７５～７６の両方；
（６）配列番号８５～８６の両方；
（７）配列番号９５～９６の両方；
（８）配列番号１０５～１０６の両方；
（９）配列番号１１５～１１６の両方；
（１０）配列番号１２５～１２６の両方；
（１１）配列番号１３５～１３６の両方；
（１２）配列番号１４５～１４６の両方；
（１３）配列番号１５５～１５６の両方；
（１４）配列番号１６５～１６６の両方；
（１５）配列番号１７５～１７６の両方；
（１６）配列番号１８５～１８６の両方；
（１７）配列番号１９５～１９６の両方；
（１８）配列番号２０５～２０６の両方；
（１９）配列番号２１５～２１６の両方；
（２０）配列番号２２５～２２６の両方；
（２１）配列番号２３５～２３６の両方；
（２２）配列番号２４５～２４６の両方；
（２３）配列番号２５５～２５６の両方；
（２４）配列番号２６５～２６６の両方；
（２５）配列番号２７５～２７６の両方；
（２６）配列番号２８５～２８６の両方；
（２７）配列番号２９５～２９６の両方；
（２８）配列番号３０５～３０６の両方；
（２９）配列番号３１５～３１６の両方；
（３０）配列番号３２５～３２６の両方；
（３１）配列番号３３５～３３６の両方；
（３２）配列番号３４５～３４６の両方；
（３３）配列番号３５５～３５６の両方；
（３４）配列番号３６５～３６６の両方；
（３５）配列番号３７５～３７６の両方；
（３６）配列番号３８５～３８６の両方；
（３７）配列番号３９５～３９６の両方；
（３８）配列番号４０５～４０６の両方；
（３９）配列番号４１５～４１６の両方；
（４０）配列番号４２５～４２６の両方；
（４１）配列番号４３５～４３６の両方；
（４２）配列番号４４５～４４６の両方；
（４３）配列番号４５５～４５６の両方；
（４４）配列番号４６５～４６６の両方；
（４５）配列番号４７５～４７６の両方；
（４６）配列番号４８５～４８６の両方；又は
（４７）配列番号４９５～４９６の両方；
のアミノ酸配列を含む、請求項７又は８に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
（１）配列番号２７～２９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３０～３２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２）配列番号３７～３９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４０～４２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３）配列番号４７～４９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号５０～５２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４）配列番号５７～５９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号６０～６２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（５）配列番号６７～６９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号７０～７２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（６）配列番号７７～７９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号８０～８２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（７）配列番号８７～８９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号９０～９２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（８）配列番号９７～９９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１００～１０２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（９）配列番号１０７～１０９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１１０～１１２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１０）配列番号１１７～１１９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１２０～１２２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１１）配列番号１２７～１２９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１３０～１３２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１２）配列番号１３７～１３９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１４０～１４２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１３）配列番号１４７～１４９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１５０～１５２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１４）配列番号１５７～１５９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１６０～１６２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１５）配列番号１６７～１６９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１７０～１７２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１６）配列番号１７７～１７９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１８０～１８２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１７）配列番号１８７～１８９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号１９０～１９２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１８）配列番号１９７～１９９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２００～２０２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（１９）配列番号２０７～２０９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２１０～２１２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２０）配列番号２１７～２１９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２２０～２２２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２１）配列番号２２７～２２９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２３０～２３２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２２）配列番号２３７～２３９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２４０～２４２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２３）配列番号２４７～２４９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２５０～２５２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２４）配列番号２５７～２５９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２６０～２６２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２５）配列番号２６７～２６９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２７０～２７２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２６）配列番号２７７～２７９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２８０～２８２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２７）配列番号２８７～２８９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号２９０～２９２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２８）配列番号２９７～２９９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３００～３０２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（２９）配列番号３０７～３０９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３１０～３１２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３０）配列番号３１７～３１９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３２０～３２２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３１）配列番号３２７～３２９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３３０～３３２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３２）配列番号３３７～３３９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３４０～３４２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３３）配列番号３４７～３４９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３５０～３５２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３４）配列番号３５７～３５９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３６０～３６２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３５）配列番号３６７～３６９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３７０～３７２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３６）配列番号３７７～３７９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３８０～３８２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３７）配列番号３８７～３８９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号３９０～３９２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３８）配列番号３９７～３９９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４００～４０２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（３９）配列番号４０７～４０９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４１０～４１２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４０）配列番号４１７～４１９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４２０～４２２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４１）配列番号４２７～４２９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４３０～４３２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４２）配列番号４３７～４３９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４４０～４４２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４３）配列番号４４７～４４９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４５０～４５２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４４）配列番号４５７～４５９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４６０～４６２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４５）配列番号４６７～４６９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４７０～４７２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；
（４６）配列番号４７７～４７９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４８０～４８２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖；又は
（４７）配列番号４８７～４８９の全てのアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド鎖及び配列番号４９０～４９２の全てのアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド鎖
を含む、単離又は精製されたタンパク質。
（【請求項１１】以降は省略されています）
発明の詳細な説明【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
この特許出願は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる、２０１７年９月２９日出願の米国仮出願第６２／５６５，３８３号の利益を主張する。
続きを表示（約 15,000 文字）【０００２】
連邦支援の研究又は開発に関する記述
本発明は、米国国立衛生研究所、国立がん研究所によって、プロジェクト番号ＢＣ０１０９８５の下、政府の支援を受けて成された。政府は、本発明において一定の権利を有する。
【０００３】
電子的に提出された文献の参照による援用
本明細書と同時に提出され、以下の通り特定されるコンピュータ可読ヌクレオチド／アミノ酸配列表は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる：２０１８年９月７日付の「７３９９８０＿ＳＴ２５．ｔｘｔ」という名称の６８７，５５５バイトのＡＳＣＩＩ（テキスト）ファイル。
【背景技術】
【０００４】
幾つかのがんは、特に該がんが転移性かつ切除不能になったとき、非常に限られた治療法の選択肢しか有しない場合がある。例えば、外科手術、化学療法、及び放射線療法等の治療法の進歩にもかかわらず、多くのがん、例えば、膵臓、結腸直腸、肺、子宮内膜、卵巣、及び前立腺のがんの予後は不良である場合がある。従って、がんの更なる治療法に対するアンメットニーズが存在する。
【発明の概要】
【０００５】
本発明の実施形態は、変異型ヒトｐ５３に対して抗原特異性を有する単離又は精製されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を提供する。
【０００６】
本発明の更なる実施形態は、関連するポリペプチド及びタンパク質、並びに本発明のＴＣＲに関連する核酸、組み換え発現ベクター、宿主細胞、細胞の集団、及び医薬組成物を提供する。
【０００７】
本発明の更なる実施形態は、哺乳類におけるがんの存在を検出する方法及び哺乳類におけるがんを治療又は予防する方法を提供する。
【図面の簡単な説明】
【０００８】
指定の漸減ペプチド濃度（μｇ／ｍＬ）のＷＴｐ５３－Ｇ２４５ペプチド（ｗｔ）（網掛け無しの棒）又は変異型ｐ５３－Ｇ２４５Ｓペプチド（ｍｕｔ）（網掛け棒）のいずれかをパルスした自己樹状細胞（ＤＣ）と共培養した後、患者４１２７由来の指定のＴＣＲのうちの１つを形質導入した自己ＰＢＬの共培養後に測定された、ＩＦＮ－γの濃度（ｐｇ／ｍＬ）を示すグラフである。
指定の漸減ペプチド濃度（μｇ／ｍＬ）のＷＴｐ５３－Ｇ２４５ペプチド（ｗｔ）（網掛け無しの棒）又は変異型ｐ５３－Ｇ２４５Ｓペプチド（ｍｕｔ）（網掛け棒）のいずれかをパルスした自己ＤＣと、患者４１２７由来の指定のＴＣＲのうちの１つを形質導入した自己ＰＢＬとを共培養した後に検出された、４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（ＣＤ４＋ｍＴＣＲβ＋の％）を示すグラフである。
表Ａに示すペプチドのうちの１つをパルスした自己ＤＣと、患者４１２７由来の指定のＴＣＲのうちの１つを形質導入した自己ＰＢＬとを共培養した後に検出された、４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（ＣＤ４＋ｍＴＣＲβ＋の％）を示すグラフである。
指定のＨＬＡアリルのうちの１つを形質導入し、ＤＭＳＯ又は指定のペプチドのうちの１つをパルスしたＣＯＳ７細胞と、患者４１２７由来のＴＩＬ又は指定のＴＣＲのうちの１つを形質導入したＴ細胞とを共培養した後に測定された、ＩＦＮ－γの濃度（ｐｇ／ｍＬ）を示すグラフである。
指定のＨＬＡアリルのうちの１つを形質導入し、ＤＭＳＯ又は指定のペプチドのうちの１つをパルスしたＣＯＳ７細胞と、患者４１２７由来のＴＩＬ又は指定のＴＣＲのうちの１つを形質導入したＴ細胞とを共培養した後に検出された、４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（ＣＤ４＋ｍＴＣＲβ＋の％）を示すグラフである。
（１）無関係（ＩＲＲ；左の斜線付きの白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；左の斜線付きの灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；灰色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした、あるいは（２）ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；右の斜線付きの白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｇ２４５配列（ＬＰ－ｐ５３－ｗｔ－Ｇ２４５；右の斜線付きの灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｇ２４５Ｓ（ＬＰ－ｐ５３－ｍｕｔ－Ｇ２４５Ｓ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした、同種（ＤＲＢ３
＊
０１：０１：０１又はＤＲＢ３
＊
０２：０２：０１）ＡＰＣと、患者４１２７由来のＴＩＬとを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのスポット数を示すグラフである。
（１）無関係（ＩＲＲ；左の斜線付きの白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；左の斜線付きの灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；灰色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした、あるいは（２）ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；右の斜線付きの白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｇ２４５配列（ＬＰ－ｐ５３－ｗｔ－Ｇ２４５；右の斜線付きの灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｇ２４５Ｓ（ＬＰ－ｐ５３－ｍｕｔ－Ｇ２４５Ｓ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした、同種（ＤＲＢ３
＊
０１：０１：０１又はＤＲＢ３
＊
０２：０２：０１）ＡＰＣと、４１２７－ＴＣＲ１を発現しているＴ細胞とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのスポット数を示すグラフである。
図８ＡはＴＭＧ１及び指定のＨＬＡアリルのプラスミドをトランスフェクトしたＣｏｓ７細胞と、患者４１９６を治療するために使用した輸液バッグからのＴＩＬとを共培養した後に測定されたＩＦＮ－γ分泌（スポット／２×１０
４
個の細胞）を示すグラフである。図８Ｂは候補最小エピトープ（ＨＭＴＥＶＶＲＨＣ（配列番号５３０）又は（ＳＱＨＭＴＥＶＶＲＨ（配列番号５３１））をパルスした自己ＤＣと、患者４１９６を治療するために使用した輸液バッグからのＴＩＬとを共培養した後に測定されたＩＦＮ－γ分泌（スポット／２×１０
４
個の細胞）を示すグラフである。単独で培養したＴ細胞が対照の役割を果たした。
図９Ａ～９Ｄは以下のＴＣＲ：ＡＶ１２／ＢＶ６－１（Ａ）、ＡＶ２／ＢＶ６－１（Ｂ）、ＡＶ６／ＢＶ１１（Ｃ）、又はＡＶ３８／ＢＶ１０－３（Ｄ）のうちの１つを形質導入した細胞と、指定の濃度（μｇ／ｍＬ）の最小ＷＴ（丸）又は変異型（ｍｕｔ）（四角）のエピトープをパルスしたＤＣとを共培養した後に検出されたｍＴＣＲβ＋ＣＤ８＋４１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。パルスされたＤＣと形質導入されていない（ＵＴ）細胞との共培養（三角）が対照の役割を果たした。示す結果は、２回の実験の代表例である。
図１０Ａ～１０Ｂは以下のＴＣＲ：ＡＶ１２／ＢＶ６－１（黒色の三角）、ＡＶ６／ＢＶ１１（丸）、又はＡＶ３８／ＢＶ１０－３（四角）のうちの１つを形質導入した細胞と、指定の濃度の最小変異型エピトープをパルスしたＴ２細胞とを共培養した後に測定された、ＩＦＮ－γ分泌（ｐｇ／ｍＬ）（Ａ）及び４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（％、ｍＴＣＲβ＋）（Ｂ）を示すグラフである。パルスされたＴ２細胞と形質導入されていない（ＵＴ）細胞との共培養（白色の三角）が対照の役割を果たした。
ＴＣＲ形質導入細胞と指定の標的細胞株との共培養後に検出された２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。エフェクタ細胞に、ＡＶ１２／ＢＶ６－１（黒色の棒）、ＡＶ６／ＢＶ１１（縞模様の棒）、又はＡＶ３８／ＢＶ１０－３（灰色の棒）を形質導入した。ＨＬＡ－Ａ
＊
０２：０１が形質導入された標的細胞を、ＬＳ１２３－Ａ２、ＣＣＲＦ－ＣＥＭ－Ａ２、及びＡＵ－５６５－Ａ２によって示す。ペプチドをパルスした標的細胞を（＋）によって示す。ペプチドをパルスしていない標的細胞を（－）によって示す。標的細胞株と共培養した形質導入されていないエフェクタ細胞（網掛け無しの棒）を対照として使用した。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２３８のＴＩＬ断片Ｆ１～Ｆ２４（ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）又は変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２３８のＴＩＬ断片Ｆ１～Ｆ２４（ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２３８のＴＩＬ断片Ｆ１～Ｆ２４（ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ８＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）又は変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２３８のＴＩＬ断片Ｆ１～Ｆ２４（ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ８＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
（１）ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）をパルスした、（２）変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした、（３）無関係のＴＭＧ（ＴＭＧ－ＩＲＲ；灰色の斜線付き棒）をエレクトロポレーションした、又は（４）変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ配列を含有するｐ５３－ｍｕｔ－ＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２５３由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４；ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧ（ＴＭＧ）をエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２７３由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２７３のＴＩＬ断片Ｆ１～Ｆ２４（ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２７３由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２７３由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
（１）無関係（ＩＲＲ；右の斜線付きの黒色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ｗｔ－ＴＭＧ；左の斜線付きの黒色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ｍｕｔ－ＴＭＧ；灰色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした、あるいは（２）ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｙ２２０配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｙ２２０－ＷＴ；横線付きの黒色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ（ＬＰ－ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４１４９由来の自己ＰＢＬ（４１４９－ＴＣＲａ２ｂ１又は４１４９－ＴＣＲａ２ｂ２を転移）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。ホルボール１２－ミリスタート１３－アセタート（ＰＭＡ）及びイオノマイシン（Ｉｏｎｏ）がポジティブコントロールであった（灰色の棒）。
（１）無関係（ＩＲＲ；右の斜線付きの黒色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ｗｔ－ＴＭＧ；左の斜線付きの黒色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ｍｕｔ－ＴＭＧ；灰色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした、あるいは（２）ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｙ２２０配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｙ２２０－ＷＴ；横線付きの黒色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ（ＬＰ－ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、ＴＣＲ（４１４９－ＴＣＲａ２ｂ１又は４１４９－ＴＣＲａ２ｂ２）を転移させた患者４１４９由来の自己ＰＢＬとを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。ＰＭＡ及びＩｏｎｏがポジティブコントロールであった（灰色の棒）。
表Ｆのペプチドのうちの１つをパルスした自己ＤＣと、患者４１４９由来のＴＩＬとを共培養した後に検出された４－１ＢＢ＋細胞の百分率（ＣＤ４＋Ｔ細胞の％）を示すグラフである。
個々のＨＬＡアリル＋／－ＴＭＧをコトランスフェクトしたＣｏｓ７細胞と、４１４９－ＴＣＲａ２ｂ２転移Ｔ細胞とを共培養した後のＩＦＮ－γ分泌（ｐｇ／ｍＬ）を示すグラフである。ＴＭＧをトランスフェクトしていない細胞に、ｐ５３Ｙ２２０Ｃ１５ｍｅｒペプチドをパルスした。パルスした標的細胞を網掛け棒によって示す。ＴＭＧをトランスフェクトした標的細胞を、網掛け無しの棒によって示す。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又は変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２１３由来のＴＩＬ断片（Ｆ２及びＦ２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ８＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又は変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２１３由来のＣＤ４＋Ｔ細胞とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。ＩＦＮ－γの分泌を白色の棒によって示す。４－１ＢＢの発現を黒色の棒によって示す。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２６８由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２６８由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２６８由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｑ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２６８由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ８＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２６６由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２６６由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ８＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２６６由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２６６由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２４、ｎ＝２４）とを共培養した後に検出された、ＣＤ８＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
９種のｐ５３スプライスバリアントのアミノ酸配列のアラインメントを示す。ＳＰ｜Ｐ０４６３７｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号１）；ＳＰ｜Ｐ０４６３７－２｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５３５）；ＳＰ｜Ｐ０４６３７－３｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５３６）；ＳＰ｜Ｐ０４６３７－４｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５３７）；ＳＰ｜Ｐ０４６３７－５｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５３８）；ＳＰ｜Ｐ０４６３７－６｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５３９）；ＳＰ｜Ｐ０４６３７－７｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５４０）；ＳＰ｜Ｐ０４６３７－８｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５４１）；及びＳＰ｜Ｐ０４６３７－９｜Ｐ５３＿ＨＵＭＡＮ（配列番号５４２）。
漸減濃度の、ＷＴ（白色の丸）又は変異型（黒色の四角）ｐ５３－Ｇ２４５Ｓの配列に対応する２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、４１２７－Ｏ３７－ＴＣＲを形質導入したＴ細胞とを共培養した後に検出された４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（ｍＴＣＲβ＋の％）を示すグラフである。
図３７Ａ～３７Ｃは指定のＨＬＡアリルのうちの１つをコトランスフェクトし、２５アミノ酸のｐ５３－Ｇ２４５ＳペプチドをパルスしたＣＯＳ７細胞と、４１２７－Ｏ３７－ＴＣＲ（Ａ）、４１２７－ＴＰ５３－Ｇ２４５Ｓ－ＴＣＲ１（Ｂ）、又は４１２７－Ｏ１０２－ＴＣＲ（Ｃ）を形質導入したＴ細胞とを共培養した後に測定された、４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（ｍＴＣＲβ＋の％）（左のｙ軸；斜線付きの棒）及びＩＦＮ－γ（ｐｇ／ｍＬ）（右のｙ軸；黒色の棒）を示すグラフである。
無関係の変異（ＴＭＧ－ＩＲＲ）、ＷＴｐ５３配列（ＴＰ５３－ｗｔ－ＴＭＧ）、又はＲ１７５Ｈを含む変異型ｐ５３配列（ＴＰ５３－ｍｕｔ－ＴＭＧ）をコードしているＴＭＧをトランスフェクトした自己ＡＰＣと、患者４１４１由来のＴＩＬ（断片培養物１２）とを共培養した後に測定された、４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（ＣＤ８＋の％）（右のｙ軸；黒色の棒）及びＩＦＮ－γ（２×１０
４
個の細胞あたりのスポット）（左のｙ軸；斜線付きの棒）を示すグラフである。培地のみ、並びにＰＭＡ及びイオノマイシンが、それぞれ、ネガティブコントロール及びポジティブコントロールであった。
指定のＨＬＡアリル及び追加の遺伝子無し（ＨＬＡのみ；白色の棒）、ＷＴＴＰ５３ＴＭＧ（灰色の斜線付きの棒）、又はｐ５３－Ｒ１７５Ｈ配列を含有する変異型（黒色の棒）ＴＰ５３ＴＭＧをコトランスフェクトしたＣｏｓ７細胞と、患者４１４１由来のＴＩＬ（断片培養物１２）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
モック（ＴＣＲ無し）又は４１４１－ＴＣＲ１ａ２を発現しているＴ細胞をＴ２腫瘍細胞（ＨＬＡ－Ａ
＊
０２：０１を発現）と共培養した後に測定された、ＩＦＮ－γの濃度（ｐｇ／ｍＬ）を示すグラフである。ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；灰色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ１７５ペプチド（斜線付きの灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ１７５Ｈペプチド（黒色の棒）から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）されたペプチドを、Ｔ２細胞にパルスした。培地のみ（白色の棒）並びにＰＭＡ及びイオノマイシン（格子模様の棒）が、それぞれ、ネガティブコントロール及びポジティブコントロールであった。データは、平均±ＳＥＭ（ｎ＝３）である。
操作されていない（網掛け無しの棒）又は完全長ｐ５３－Ｒ１７５Ｈタンパク質を過剰発現するようにされた（網掛け棒）Ｓａｏｓ２細胞（ｐ５３－ＮＵＬＬ及びＨＬＡ－Ａ
＊
０２：０１＋）と、４１４１－ＴＣＲ１ａ２を発現しているＴ細胞とを共培養した後の、指定のマーカーのうちの１つの発現について陽性である細胞の百分率を示すグラフである。データは、平均±ＳＥＭ（ｎ＝３）である。統計解析のために２つの細胞株間で各サイトカインについてスチューデントの両側ｔ検定を実施した（
＊＊＊
ｐ＜０．００１）。
（１）無関係（ＴＭＧ－ＩＲＲ）、ＷＴｐ５３（ＴＭＧ－ｐ５３－ＷＴ）、又は変異型ｐ５３（ＴＭＧ－ｐ５３－ＭＵＴ）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした、あるいは（２）ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ）又はＷＴｐ５３－Ｙ２２０配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｙ２２０－ＷＴ）若しくは変異型ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ（ＬＰ－ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ－ＭＵＴ）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、ＴＩＬ（患者４２５９由来の断片培養物６）とを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ陽性細胞の百分率を示すグラフである。
漸減濃度の、ＷＴｐ５３配列（白色の丸）又は変異型ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ（黒色の四角）に対応する２５アミノ酸ペプチドを３７℃で２時間パルスした自己ＡＰＣと、患者４２５９由来のＴＩＬ断片培養物（６番）とを共培養した後に検出されたＣＤ４＋４－１ＢＢ陽性細胞の百分率を示すグラフである。
ＤＭＳＯ、ＷＴｐ５３－Ｙ２２０ペプチド、又は変異型ｐ５３－Ｙ２２０Ｃペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２５９由来のＴＩＬとを共培養した後に検出されたＣＤ４＋４－１ＢＢ陽性細胞の百分率を示すグラフである。
患者４２５９由来の指定のＨＬＡアリルをコトランスフェクトし、ＤＭＳＯ（白色の棒）又はｐ５３－Ｙ２２０Ｃペプチド（黒色の棒）をパルスしたＣｏｓ７細胞と、患者４２５９由来のＴＩＬ断片培養物６番とを共培養した後に検出された、４－１ＢＢ陽性細胞の百分率（ＣＤ４＋の％）を示すグラフである。
モック（ＴＣＲ無し；白色の棒）又はｐ５３－Ｙ２２０Ｃ特異的ＴＣＲ（４２５９－Ｆ６－ＴＣＲ；黒色の棒）を発現しているエフェクタＴ細胞（１０
５
個）と、ＴＣ＃４２５９標的細胞（ｐ５３－Ｙ２２０Ｃ及びＨＬＡ－ＤＲＢ１
＊
０４：０１：０１を内因的に発現している）とを共培養した後に検出された４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。ＴＣ＃４２５９細胞を、何も無しで、Ｗ６／３２汎ＨＬＡクラスＩ特異的遮断抗体、ＩＶＡ１２汎ＨＬＡクラスＩＩ特異的遮断抗体、又は変異型ｐ５３－Ｙ２２０Ｃペプチドと共にインキュベートした。培地のみ（ＴＣ無し）並びにＰＭＡ及びイオノマイシンが、それぞれ、ネガティブコントロール及びポジティブコントロールであった。データは、平均±ＳＥＭ（ｎ＝３）である。統計解析のために指定の通りの群間でスチューデントの両側ｔ検定を実施した（
＊＊
ｐ＜０．０１及び
＊＊＊
ｐ＜０．００１）。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）、ＷＴｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２８５由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２２及びＦ２４、ｎ＝２３）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ１７５配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ１７５－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ１７５Ｈ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ１７５Ｈ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２８５のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２２及びＦ２４、ｎ＝２３）とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個のエフェクタ細胞あたりのＩＦＮ－γ陽性スポット数を示すグラフである。
無関係（ＩＲＲ；白色の棒）、ＷＴ型ｐ５３（ｐ５３－ＷＴ；灰色の棒）、又は変異型ｐ５３（ｐ５３－ＭＵＴ；黒色の棒）の配列から構成されたＴＭＧをエレクトロポレーションした自己ＡＰＣと、患者４２８５由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２２及びＦ２４、ｎ＝２３）とを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；白色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ１７５配列（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ１７５－ＷＴ；灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ１７５Ｈ（ＬＰ－ｐ５３－Ｒ１７５Ｈ－ＭＵＴ；黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２８５由来のＴＩＬ断片（Ｆ１～Ｆ２２及びＦ２４、ｎ＝２３）とを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。
指定のＨＬＡアリルをトランスフェクトし、ＤＭＳＯ（ペプチドビヒクル；灰色及び黒色の斜線付きの棒）又は変異型ｐ５３－Ｒ１７５Ｈペプチド（灰色、格子模様付き、及び黒色の棒）をパルスしたＣｏｓ７細胞と、ＴＩＬ断片培養物４２８５－Ｆ６、４２８５－Ｆ９、及び４２８５－Ｆ１０とを共培養した後に検出された４－１ＢＢ＋細胞の百分率（ＣＤ４＋の％）を示すグラフである。
漸減濃度の、ＷＴ（白色の丸及び四角）又は変異型（黒色の丸及び四角）ｐ５３－Ｒ１７５Ｈの配列に対応する２５又は１５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、４２８５－ＴＣＲ１を転移させたＴ細胞とを共培養した後に検出された４－１ＢＢ＋細胞の百分率（ＣＤ４＋の％）を示すグラフである。
患者４２６６由来の個々のＨＬＡアリルをコトランスフェクトし、ペプチド無し（白色の棒）、ＤＭＳＯ（ペプチドビヒクル；灰色の棒）、野生型ｐ５３－Ｒ２４８ペプチド（灰色の斜線付きの棒）、又は変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗペプチド（黒色の棒）をパルスしたＣｏｓ７細胞と、患者４２６６由来のＴＩＬとを共培養した後に検出された、４－１ＢＢ＋細胞の百分率（ＣＤ８＋の％）を示すグラフである。データは、平均±ＳＥＭ（ｎ＝３）である。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；灰色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（斜線付きの灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ（黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、モック（ＴＣＲ無し）、４２６６－ＴＣＲ１、４２６６－ＴＣＲ２、４２６６－ＴＣＲ３、又は４２６６－ＴＣＲ４を発現しているＴ細胞とを共培養した後に検出された、４－１ＢＢ＋細胞の百分率（ＣＤ８＋の％）を示すグラフである。培地のみ（白色の棒）並びにＰＭＡ及びイオノマイシン（格子模様の棒）が、それぞれ、ネガティブコントロール及びポジティブコントロールであった。
患者４２６６から摘出され、次いで、免疫無防備状態のマウスで連続継代された異種移植腫瘍断片から樹立された腫瘍細胞（ＴＣ）株（ＴＣ＃４２６６）と、モック（ＴＣＲ無し）又はｐ５３－Ｒ２４８Ｗ特異的ＴＣＲ（４２６６－ＴＣＲ２、４２６６－ＴＣＲ３、又は４２６６－ＴＣＲ４）を発現しているＴ細胞とを共培養した後に検出された４－１ＢＢ＋細胞の百分率（ＣＤ８＋の％）を示すグラフである。ＴＣ＃４２６６細胞を、何も無しで（黒色の棒）、Ｗ６／３２汎ＨＬＡクラスＩ特異的遮断抗体（右の灰色の斜線付き棒）、ＩＶＡ１２汎ＨＬＡクラスＩＩ特異的遮断抗体（灰色の棒）、又は変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗペプチド（左の灰色の斜線付き棒）のいずれかと共にインキュベートした。培地のみ（ＴＣ無し；白色の棒）並びにＰＭＡ及びイオノマイシン（灰色の格子模様の棒）が、それぞれ、ネガティブコントロール及びポジティブコントロールであった。
無関係の変異（灰色の棒）、野生型ｐ５３配列（灰色の斜線付きの棒）、又はｐ５３－Ｒ２４８Ｗを含む変異型ｐ５３配列（黒色の棒）をコードしているＴＭＧをトランスフェクトした自己ＡＰＣと、患者４２７３由来のＴＩＬとを共培養した後に検出された、ＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。培地のみ（白色の棒）、並びにＰＭＡ及びイオノマイシン（格子模様の棒）が、それぞれ、ネガティブコントロール及びポジティブコントロールであった。
野生型（白色の丸）又はｐ５３－Ｒ２４８Ｗネオエピトープ由来の変異型（黒色の四角）に対応する２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、患者４２７３由来のＴＩＬとを共培養した後に検出されたＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。ＤＭＳＯがペプチドビヒクルであった。
１４アミノ酸が重複しているｐ５３－Ｒ２４８Ｗネオエピトープ由来の１５アミノ酸ペプチド（太線部がアミノ酸置換）をパルスした自己ＡＰＣと、患者４２７３由来のＴＩＬとを共培養した後に検出されたＣＤ４＋４－１ＢＢ＋細胞の百分率を示すグラフである。ＤＭＳＯがペプチドビヒクルであり、培地のみ（Ｔ細胞のみ）並びにＰＭＡ及びイオノマイシンが対照であった。２５アミノ酸ペプチド（ｗｔｐ５３－Ｒ２４８及び変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ）が、１５アミノ酸ペプチドに対する更なる対照であった。ペプチドは、ＹＭＣＮＳＳＣＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰ（配列番号５９２）；ＭＣＮＳＳＣＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩ（配列番号５９３）；ＣＮＳＳＣＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬ（配列番号５９４）；ＮＳＳＣＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬＴ（配列番号５９５）；ＳＳＣＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬＴＩ（配列番号５９６）；ＳＣＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬＴＩＩ（配列番号５９７）；ＣＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬＴＩＩＴ（配列番号５９８）；ＭＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬＴＩＩＴＬ（配列番号５９９）；ＧＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬＴＩＩＴＬＥ（配列番号６００）；ＧＭＮ
Ｗ
ＲＰＩＬＴＩＩＴＬＥＤ（配列番号６０１）；及びＭＮＷＲＰＩＬＴＩＩＴＬＥＤＳ（配列番号６０２）である。
それぞれｐ５３－Ｒ２４８Ｗネオ抗原の有り無しで、患者４２７３由来の個々のＨＬＡアリルとＷＴ（白色の棒）又は変異型（黒色の棒）ＴＰ５３ＴＭＧのいずれかとをコトランスフェクトしたＣｏｓ７細胞を、患者４２７３由来のＴＩＬと共培養した後に分泌されたＩＦＮ－γの濃度（ｐｇ／ｍＬ）を示すグラフである。
ペプチドビヒクル（ＤＭＳＯ；灰色の棒）、又はＷＴｐ５３－Ｒ２４８配列（斜線付きの灰色の棒）若しくは変異型ｐ５３－Ｒ２４８Ｗ（黒色の棒）配列から構成された精製（ＨＰＬＣによって＞９５％）された２５アミノ酸ペプチドをパルスした自己ＡＰＣと、モック（ＴＣＲ無し）又は４２７３－ＴＣＲ１ａ２を発現しているＴ細胞とを共培養した後に測定された、２×１０
４
個の細胞あたりのＩＦＮ－γスポット数を示すグラフである。培地のみ（白色の棒）並びにＰＭＡ及びイオノマイシン（格子模様の棒）が、それぞれ、ネガティブコントロール及びポジティブコントロールであった。
【発明を実施するための形態】
【０００９】
腫瘍タンパク質Ｐ５３（「ＴＰ５３」又は「ｐ５３」とも称される）は、例えば、細胞分裂を制御することによって腫瘍抑制因子として作用する。ｐ５３タンパク質は、細胞の核内に位置し、そこでＤＮＡに直接結合する。ＤＮＡが損傷を受けると、ｐ５３タンパク質は、ＤＮＡを修復するか又は損傷を受けた細胞をアポトーシスさせるかの決定に関与する。ＤＮＡを修復することができる場合、ｐ５３は他の遺伝子を活性化させて損傷を修復する。ＤＮＡを修復することができない場合、ｐ５３タンパク質は、細胞が分裂するのを阻止し、該細胞にシグナルを伝達してアポトーシスさせる。変異型の又は損傷を受けたＤＮＡを有する細胞の分裂を停止させることによって、ｐ５３は腫瘍の発達を阻止するのに役立つ。野生型（ＷＴ）（正常）完全長ｐ５３は、配列番号１のアミノ酸配列を含む。
【００１０】
ｐ５３タンパク質における変異によって、ｐ５３タンパク質の腫瘍抑制因子機能が低下するか又は失われることがある。あるいは又は更に、ｐ５３変異は、ドミナントネガティブ方式でＷＴｐ５３に干渉することによる機能獲得型変異であり得る。変異型ｐ５３タンパク質は、様々なヒトがん、例えば、胆管がん、黒色腫、結腸がん、直腸がん、卵巣がん、子宮内膜がん、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、神経膠芽腫、子宮頸がん、頭頸部がん、乳がん、膵臓がん、又は膀胱がんのいずれかで発現し得る。
（【００１１】以降は省略されています）

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