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公開番号2024150516
公報種別公開特許公報(A)
公開日2024-10-23
出願番号2024109831,2022505853
出願日2024-07-08,2021-02-10
発明の名称SARS-CoV-2の構造タンパク質に対する抗体のエピトープ、該エピトープに反応する抗体、該抗体を用いてSARS-CoV-2を検出する方法、該抗体を含むSARS-CoV-2検出キット、該エピトープのポリペプチドを含む抗SARS-CoV-2抗体を検出する方法、該エピトープのポリペプチドを含む抗SARS-CoV-2抗体検出キット、該エピトープのポリペプチドを含むSARS-CoV-2用ワクチン及び該抗体を含むSARS-CoV-2感染症治療薬
出願人デンカ株式会社
代理人個人,個人,個人
主分類C07K 16/10 20060101AFI20241016BHJP(有機化学)
要約【課題】SARS-CoV-2を検出する抗体、該抗体を用いてSARS-CoV-2を検出する方法及び該抗体を含む検出キットを提供すること。SARS-CoV-2に加えてMERS-CoV、SARS-CoV等の重篤な呼吸器症状を引き起こすヒト感染性コロナウイルスを同時に検出する抗体、該抗体を用いてSARS-CoV-2及びヒト感染性コロナウイルスを同時に検出する方法及び該抗体を含む検出キットを提供すること。
【解決手段】SARS-CoV-2の構造タンパク質と特異的に反応するモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片であって、前記SARS-CoV-2の構造タンパク質がN-タンパク質である、前記モノクローナル抗体又はその抗原結合性断片、並びに、SARS-CoV-2のタンパク質に反応する抗体と特異的に反応するハプテンであって、前記SARS-CoV-2のタンパク質がN-タンパク質である、前記ハプテン。
【選択図】なし
特許請求の範囲【請求項１】
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質と特異的に反応するモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片であって、前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質がＮ－タンパク質である、前記モノクローナル抗体又はその抗原結合性断片。
続きを表示（約 1,500 文字）【請求項２】
前記Ｎ－タンパク質の１９～４９番目（配列番号１８）、４０１～４１９番目（配列番号２５）、１～１８番目（配列番号１７）、３６２～３７９番目（配列番号２３）、３７７～３９５番目（配列番号２４）、２４７～２６７番目（配列番号２１）、１７４～２０７番目（配列番号１９）、２３０～２５２番目（配列番号２０）又は３３６～３５０番目（配列番号２２）のアミノ酸領域に結合する、請求項１に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片。
【請求項３】
前記Ｎ－タンパク質の２０～４８番目、４０３～４１７番目、１～１２番目、３６６～３７７番目、３８１～３９１番目、２５４～２６３番目、１７５～２０６番目、２３４～２５０番目又は３３８～３４８番目のアミノ酸領域に結合する、請求項１又は２に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片。
【請求項４】
前記Ｎ－タンパク質の２７～４１番目、４０６～４１５番目、４～１１番目、３６７～３７５番目、３８４～３９０番目、２５６～２６１番目、１８５～１９６番目、２３７～２４７番目又は３４０～３４７番目のアミノ酸領域に結合する、請求項１又は２に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片。
【請求項５】
請求項１～４のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片と検体とを接触させ、免疫学的測定法によりＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出することを含む、検体中のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出する方法。
【請求項６】
Ｎ－タンパク質の１９～４９番目（配列番号１８）、４０１～４１９番目（配列番号２５）、１～１８番目（配列番号１７）、３６２～３７９番目（配列番号２３）、３７７～３９５番目（配列番号２４）、２４７～２６７番目（配列番号２１）、１７４～２０７番目（配列番号１９）、２３０～２５２番目（配列番号２０）及び３３６～３５０番目（配列番号２２）からなる群より選択されるアミノ酸領域に同時に結合することのできる、少なくとも２種類のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片を用いる、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
請求項１～４のいずれか一項に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片を含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の検出キット。
【請求項８】
Ｎ－タンパク質の１９～４９番目（配列番号１８）、４０１～４１９番目（配列番号２５）、１～１８番目（配列番号１７）、３６２～３７９番目（配列番号２３）、３７７～３９５番目（配列番号２４）、２４７～２６７番目（配列番号２１）、１７４～２０７番目（配列番号１９）、２３０～２５２番目（配列番号２０）及び３３６～３５０番目（配列番号２２）からなる群より選択されるアミノ酸領域に同時に結合することのできる、少なくとも２種類のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片を含む、請求項７に記載のキット。
【請求項９】
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質、及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２以外のヒト感染性コロナウイルスの構造タンパク質と特異的に反応するモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片であって、前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質がＮ－タンパク質であり、前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２以外のヒト感染性コロナウイルスの構造タンパク質がＮ－タンパク質である、前記モノクローナル抗体又はその抗原結合性断片。
【請求項１０】
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２以外のヒト感染性コロナウイルスが、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ及び／又はＳＡＲＳ－ＣｏＶである、請求項９に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片。
（【請求項１１】以降は省略されています）
発明の詳細な説明【技術分野】
【０００１】
本発明は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質に対する抗体が認識するエピトープ、該エピトープに反応する抗体、該抗体を用いてＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出する方法、該抗体を含むＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２検出キット、該エピトープのポリペプチドを含む抗ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２抗体を検出する方法、該エピトープのポリペプチドを含む抗ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２抗体検出キット及び該エピトープのポリペプチドを含むＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２用ワクチン及び該抗体を含むＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染症治療薬に関する。
続きを表示（約 2,200 文字）【背景技術】
【０００２】
コロナウイルスは正の一本鎖ＲＮＡゲノムとらせん対称性のヌクレオカプシドをもつエンベロープウイルスである。ヒトに感染するコロナウイルスとしてはベータコロナウイルスがあり、中でもＭＥＲＳコロナウイルス（ＭＥＲＳ－ＣｏＶ）及びＳＡＲＳコロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ）は重篤な呼吸器症状を引き起こすことが知られている。
【０００３】
２０１９年に中国で新型コロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）が発生し、２０２０年２月現在東アジアを中心に東南アジア、中東、ヨーロッパなどで感染拡大が続いている。そのため、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する治療法やワクチンに加えて、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を早期に発見して感染拡大を抑えるべく、迅速かつ簡便な検出法の開発が急務となっている。
【０００４】
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の発生以降、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の抗原性及び候補エピトープに関する報告がなされているが（例えば、非特許文献１）、当該候補エピトープはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対するワクチンの開発を指向したものであり、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の検出に適したエピトープ及び当該エピトープを認識する抗体については未だ報告されていない。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００５】
Suresh Kumar, Preprints, doi:https://www.preprints.org/manuscript/202002.0071/v1
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出する抗体、該抗体を用いてＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出する方法及び該抗体を含む検出キットを提供することを目的とする。また、本発明は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に加えてＭＥＲＳ－ＣｏＶ、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ等の重篤な呼吸器症状を引き起こすヒト感染性コロナウイルスを同時に検出する抗体、該抗体を用いてＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びヒト感染性コロナウイルスを同時に検出する方法及び該抗体を含む検出キットを提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
従来、抗原性を予測する複数のアルゴリズムが報告されているが（例えば、Chou PY, Fasman GD. 1978. Prediction of the secondary structure ofproteins from their amino acid sequence. Adv Enzymol Relat Areas Mol Biol47:45-148）、これらのアルゴリズムは互いに相反する指標を含んでいることから、個々のアルゴリズムでは抗原性予測の精度に乏しいという問題点があった。本発明者らはこれらのアルゴリズムを統合して抗原性の精度を高めることができるための改良を行い、当該改良したアルゴリズムを用いて得られたＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を構成する構造タンパク質分子全体についての抗原性の強弱スコア（図１～４）から、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を構成する構造タンパク質における特定のアミノ酸配列を有する領域においてウイルス抗原性が強く、当該特定のアミノ酸配列がＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出する抗体の認識するエピトープ（ポリペプチド）として有用であることを見出し、本発明を完成した。
【０００８】
すなわち、本発明はＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質と特異的に反応するモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片及び該抗体を含むＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の検出キットを提供する。ここで、前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質は、Ｓ－タンパク質、Ｎ－タンパク質、Ｍ－タンパク質及びＥ－タンパク質からなる群より選択される少なくとも１種のタンパク質である。
【０００９】
また、本発明はＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質と特異的に反応するモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片と検体とを接触させ、免疫学的測定法によりＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出することを含む、検体中のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出する方法を提供する。検体中のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２を検出する方法においては、各構造タンパク質について少なくとも２種類のモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片を用いるサンドイッチ法が好ましい。
【００１０】
また、本発明はＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質、及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２以外のヒト感染性コロナウイルス（好ましくは、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ及び／又はＳＡＲＳ－ＣｏＶ）の構造タンパク質と特異的に反応するモノクローナル抗体又はその抗原結合性断片及び該抗体を含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２以外のヒト感染性コロナウイルス（好ましくは、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ及び／又はＳＡＲＳ－ＣｏＶ）の検出キットを提供する。ここで、前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の構造タンパク質は、Ｓ－タンパク質、Ｎ－タンパク質、Ｍ－タンパク質及びＥ－タンパク質からなる群より選択される少なくとも１種のタンパク質であり、前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２以外のヒト感染性コロナウイルスの構造タンパク質は、Ｓ－タンパク質、Ｎ－タンパク質、Ｍ－タンパク質及びＥ－タンパク質からなる群より選択される少なくとも１種のタンパク質である。
（【００１１】以降は省略されています）

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