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公開番号2024084811
公報種別公開特許公報(A)
公開日2024-06-25
出願番号2024060574,2021525738
出願日2024-04-04,2019-11-08
発明の名称情報処理方法、情報処理装置及びシステム
出願人ソニーグループ株式会社
代理人弁理士法人酒井国際特許事務所
主分類G01N 21/64 20060101AFI20240618BHJP(測定;試験)
要約【課題】測定データを次元圧縮したデータを用いてクラスタリングを行うことが可能であり、かつクラスタリング結果に対して測定データに遡った検証も可能な、新規かつ改良された情報処理装置、情報処理方法及びプログラムを提供する。
【解決手段】細胞からの光をセンシングした結果である第1のデータと、第1のデータを複数の蛍光に分離した結果である第2のデータとを対応付けて保持する情報保持部と、第2のデータに基づいて、細胞を複数のクラスタにクラスタリングするクラスタリング部と、クラスタリング部によるクラスタリング結果を出力する出力部と、を備え、出力部は、複数のクラスタのうちからユーザが選択したクラスタに含まれる細胞の第1のデータ又は第2のデータの少なくともいずれか1つ以上をさらに出力する、情報処理装置。
【選択図】図1
特許請求の範囲【請求項１】
細胞からの光をセンシングした結果である第１のデータと、前記第１のデータを複数の蛍光に分離した結果である第２のデータとを対応付けて保持する情報保持部と、
前記第２のデータに基づいて、前記細胞を複数のクラスタにクラスタリングするクラスタリング部と、
前記クラスタリング部によるクラスタリング結果を出力する出力部と、
を備え、
前記出力部は、前記複数のクラスタのうちからユーザが選択したクラスタに含まれる前記細胞の前記第１のデータ又は前記第２のデータの少なくともいずれか１つ以上をさらに出力する、情報処理装置。
続きを表示（約 1,100 文字）【請求項２】
前記第１のデータの次元数は、前記第２のデータの次元数よりも多い、請求項１に記載の情報処理装置。
【請求項３】
前記第１のデータは、前記細胞からの光の分光スペクトルデータである、請求項１に記載の情報処理装置。
【請求項４】
前記第２のデータは、前記複数の蛍光のうちから選択された蛍光の組み合わせにて出力される、請求項１に記載の情報処理装置。
【請求項５】
前記クラスタリング結果は、画像表示にて出力される、請求項１に記載の情報処理装置。
【請求項６】
前記情報保持部にて前記第１のデータ及び前記第２のデータを保持された第１サンプル及び第２サンプルを互いに比較するサンプル比較部をさらに備える、請求項１に記載の情報処理装置。
【請求項７】
前記サンプル比較部は、前記第１サンプルの細胞を複数のクラスタにクラスタリングし、前記第２サンプルの細胞を、前記第１サンプルのクラスタリング結果に基づく前記複数のクラスタにマッピングする、請求項６に記載の情報処理装置。
【請求項８】
前記サンプル比較部は、前記第１サンプルのクラスタリング結果と、前記第２サンプルのマッピング結果とを比較することで、前記第１サンプル及び前記第２サンプルの間の変化量が閾値以上となるクラスタを特定し、
前記出力部は、特定された前記クラスタに含まれる前記細胞の前記第１のデータ又は前記第２のデータの少なくともいずれか１つ以上をさらに出力する、請求項７に記載の情報処理装置。
【請求項９】
前記サンプル比較部は、前記第１サンプルのクラスタリング結果に基づく複数のクラスタに前記第２サンプルをマッピングする第１のクラスタリングと、前記第２サンプルのクラスタリング結果に基づく複数のクラスタに前記第１サンプルをマッピングする第２のクラスタリングとをそれぞれ行う、請求項６に記載の情報処理装置。
【請求項１０】
前記サンプル比較部は、前記第１のクラスタリング及び前記第２のクラスタリングの各々において、前記第１サンプル及び前記第２サンプルのクラスタリング結果及びマッピング結果をそれぞれ比較することで、前記第１サンプル及び前記第２サンプルの間の変化量が閾値以上となるクラスタを特定し、
前記出力部は、特定された前記クラスタに含まれる前記細胞の前記第１のデータ又は前記第２のデータの少なくともいずれか１つ以上をさらに出力する、請求項９に記載の情報処理装置。
（【請求項１１】以降は省略されています）
発明の詳細な説明【技術分野】
【０００１】
本開示は、情報処理装置、情報処理方法及びプログラムに関する。
続きを表示（約 1,400 文字）【背景技術】
【０００２】
本開示は、情報処理装置、情報処理方法及びプログラムに関する。
【０００３】
医学又は生化学等の分野では、大量の細胞の特性を迅速に測定するために、フローサイトメータを用いることが一般的になっている。フローサイトメータは、フローセルを流れる細胞に光線を照射し、該細胞から発せられる蛍光又は散乱光などを検出することで、細胞の特性を光学的に測定する装置である。
【０００４】
近年、フローサイトメータでは、一度に測定可能な蛍光の数が増加している。これにより、測定データの次元数が増加することで、組み合わせ爆発が生じるため、フローサイトメータで測定されたデータを人の手で解析することが困難になってきている。
【０００５】
そのため、下記の非特許文献１に開示されるように、フローサイトメータで測定された多次元データを機械学習によるクラスタリングによって解析することが検討されている。
【０００６】
ただし、各次元におけるノイズ量が同じである場合、次元数が多いデータの方がクラスタリングの性能が低下してしまう。そのため、フローサイトメータの測定データをクラスタリングする場合、測定データに対して蛍光分離等を行うことで次元数を削減し、次元圧縮を行ったデータをクラスタリングすることが一般的である。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００７】
El-ad David Amir, et al, "viSNE enables visualization of high dimensional single-cell data and reveals phenotypic heterogeneity of leukemia", Nature Biotechnology, 2013 Jun, 31(6), 545-552
【発明の概要】
【０００８】
しかし、多次元データに対して次元圧縮を行った場合、次元圧縮に伴って測定データに含まれる情報の一部が欠落してしまう。そのため、例えば、多次元データのクラスタリング結果が適切ではない場合、ユーザは、フローサイトメータの測定データに遡って、クラスタリング結果の妥当性を検証することが困難となっていた。
【０００９】
そこで、本開示では、測定データを次元圧縮したデータを用いてクラスタリングを行うことが可能であり、かつクラスタリング結果に対して測定データに遡った検証も可能な、新規かつ改良された情報処理装置、情報処理方法及びプログラムを提案する。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
本開示によれば、細胞からの光をセンシングした結果である第１のデータと、前記第１のデータを複数の蛍光に分離した結果である第２のデータとを対応付けて保持する情報保持部と、前記第２のデータに基づいて、前記細胞を複数のクラスタにクラスタリングするクラスタリング部と、前記クラスタリング部によるクラスタリング結果を出力する出力部と、を備え、前記出力部は、前記複数のクラスタのうちからユーザが選択したクラスタに含まれる前記細胞の前記第１のデータ又は前記第２のデータの少なくともいずれか１つ以上をさらに出力する、情報処理装置が提供される。
（【００１１】以降は省略されています）

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