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公開番号2025108660
公報種別公開特許公報(A)
公開日2025-07-23
出願番号2025069356,2021557409
出願日2025-04-21,2020-12-18
発明の名称ハイスループット単一細胞ライブラリー、並びに製造方法及び使用方法
出願人イルミナインコーポレイテッド,ユニバーシティオブワシントン,University of Washington
代理人個人
主分類C40B 40/06 20060101AFI20250715BHJP(コンビナトリアル技術)
要約【課題】複数の単一細胞から核酸を含むシークエンシングライブラリーを調製するための方法を提供すること。
【解決手段】一実施形態では、シークエンシングライブラリーは、複数の単一細胞からのクロマチンアクセス可能性を表す核酸を含む。一実施形態では、核酸は、3つのインデックス配列を含む。別の実施形態では、本開示は、単離された細胞及び核における希少事象を特性評価するための方法を提供する。
【選択図】なし
特許請求の範囲【請求項１】
明細書に記載の発明。

発明の詳細な説明【技術分野】
【０００１】
（関連出願の相互参照）
続きを表示（約 1,000 文字）【０００２】
本出願は、２０１９年１２月１９日に出願された米国特許仮出願第６２／９５０，６７０号の利益を主張し、この出願は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる
【０００３】
（政府出資）
【０００４】
本発明は、ＮａｔｉｏｎａｌＩｎｓｔｉｔｕｔｅｓｏｆＨｅａｌｔｈによって与えられた認可番号Ｔ３２ＨＬ００７８２８の下で政府の支援を受けてなされた。政府は本発明において一定の権利を有する。
【０００５】
（発明の分野）
【０００６】
本開示の実施形態は、核酸のシークエンシングに関する。具体的には、本明細書で提供される方法及び組成物の実施形態は、単一細胞コンビナトリアルインデックス付きシークエンシングライブラリーを作製し、それから配列データを取得することに関する。いくつかの実施形態では、ライブラリーから取得された配列データは包括的であり、他の実施形態では、ライブラリーから取得された配列データは、希少事象の特性評価を可能にする。
【０００７】
【背景技術】
【０００８】
単一細胞コンビナトリアルインデクシング（「ｓｃｉ－」）は、スプリットプールバーコーディングを用いて多数の単一細胞又は単一核の核酸内容を一意に標識化して、単一細胞コンビナトリアルシークエンシングライブラリーを作製する、方法論的フレームワークである。現在の単一細胞ゲノム技術は、多くの場合、トランスポソーム複合体を使用して、１工程で一意の標識を付加することを含むが、これは、大量のカスタム修飾されたトランスポゾンを必要とする。
【０００９】
単一細胞ゲノム技術は、細胞のバルク集団の研究時に決定困難である細胞間の相違を解決する。腫瘍学、免疫学、及びメタゲノミクスなど多くの重要な用途では、希少細胞の特性評価に大きな関心が寄せられており、課題が存在する。単一細胞シークエンシングの現在の方法では、並行して数百万個の単一細胞を特性評価することができる。しかしながら、濃縮を行わずに集団内の希少細胞を包括的シークエンシングベースで特性評価することは、コスト高であり、困難である。
【００１０】
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
（【００１１】以降は省略されています）

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