特許ウォッチ

公開番号2024086264
公報種別公開特許公報(A)
公開日2024-06-27
出願番号2022201302
出願日2022-12-16
発明の名称核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素
出願人国立大学法人東北大学
代理人個人,個人,個人,個人,個人
主分類C09B 19/00 20060101AFI20240620BHJP(染料;ペイント;つや出し剤;天然樹脂;接着剤;他に分類されない組成物;他に分類されない材料の応用)
要約【課題】RNAやDNAに対する選択性と結合力に優れる水素結合認識型の核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素を提供する。
【解決手段】X-Y-Zで表される化合物からなり、Xは1,3-ジアザフェノキサジン誘導体、Yはリンカー、Zは標識物質である、核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素。
【選択図】なし
特許請求の範囲【請求項１】
Ｘ－Ｙ－Ｚで表される化合物からなり、
Ｘは１，３－ジアザフェノキサジン誘導体、Ｙはリンカー、Ｚは標識物質である、核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素。
続きを表示（約 350 文字）【請求項２】
下記の化学式（１）または下記の化学式（２）で表される、請求項１に記載の核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素。
TIFF
2024086264000047.tif
107
170
（式中、Ｒは炭素数１～６の置換基を有していてもよいアルキル基、フェニル基、ベンジル基およびフェネチル基からなる群から選択されるいずれか１種であり、ｎ＝１～５の整数である。）
TIFF
2024086264000048.tif
108
170
（式中、Ｒは炭素数１～６の置換基を有していてもよいアルキル基、フェニル基、ベンジル基およびフェネチル基からなる群から選択されるいずれか１種であり、ｎ＝１～５の整数である。）

発明の詳細な説明【技術分野】
【０００１】
本発明は、核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素に関する。
続きを表示（約 1,300 文字）【背景技術】
【０００２】
リボ核酸（ＲＮＡ）やデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）に選択的に結合する蛍光分子は、ＲＮＡやＤＮＡの検出プローブとして生化学、分析化学、疾病診断分野等において極めて重要である。
【０００３】
ＲＮＡ非存在またはＲＮＡ存在下において、ＯＦＦ／ＯＮ型蛍光応答を示す１，３－ジアザフェノキサジン誘導体（Ｇ－ｃｌａｍｐ）のダイマーが、ＳｈｏｒｔｈａｉｒｐｉｎＲＮＡに対してｎｍｏｌ／Ｌの結合力を示すことが知られている（例えば、非特許文献１参照）。Ｇ－ｃｌａｍｐのダイマーの蛍光応答は、Ｇ－ｃｌａｍｐにチアゾールオレンジ（ＴＯ）系の化合物をコンジュゲートさせた化合物（ＴＯ－Ｇ－ｃｌａｍｐ）よりも不明瞭である。
【０００４】
ＤＮＡ中の８－オキソ－デオキシグアノシンを認識する蛍光プローブとしては、Ｇ－ｃｌａｍｐにリボースや塩基をコンジュゲートさせた構造を有するＧ－ｃｌａｍｐ誘導体が知られている（例えば、特許文献１参照）。
【０００５】
ＲＮＡ二重鎖の溝に結合するペプチド核酸（ＰＮＡ）をベースとした骨格に、蛍光色素としてチアゾールオレンジを導入したプローブが知られている（例えば、特許文献２参照）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００６】
国際公開第２０１２／０７７８００号
特開２０２１－２３２９１号公報
【非特許文献】
【０００７】
Ｍｕｒａｓｅ，Ｈｉｒｏｔａｋａ、Ｎａｇａｔｓｕｇｉ，Ｆｕｍｉ、“ＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆｔｈｅｂｉｎｄｉｎｇｍｏｌｅｃｕｌｅｓｆｏｒｔｈｅＲＮＡｈｉｇｈｅｒ－ｏｒｄｅｒｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓｂａｓｅｄｏｎｔｈｅｇｕａｎｉｎｅ－ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎｂｙｔｈｅＧ－ｃｌａｍｐ”、Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆ＭｅｄｉｃｉｎａｌＣｈｅｍｉｓｔｒｙＬｅｔｔｅｒｓ，２０１９年、第２９巻、第１１号、ｐ．１３２０－１３２４。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
しかしながら、ＲＮＡ検出プローブやＤＮＡ検出プローブとして一般的に使用される化合物は、ＲＮＡやＤＮＡに対する選択性と結合力に改善の余地があった。また、既存のプローブはほとんどがインターカレーターであり、蛍光指示薬競合置換アッセイの観点から、結合様式の多様化が求められていた。
【０００９】
本発明は、上記事情に鑑みてなされたものであって、ＲＮＡやＤＮＡに対する選択性と結合力に優れる水素結合認識型の核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
本発明は、以下の態様を有する。
［１］Ｘ－Ｙ－Ｚで表される化合物からなり、
Ｘは１，３－ジアザフェノキサジン誘導体、Ｙはリンカー、Ｚは標識物質である、核酸内グアニン塩基結合性蛍光色素。
（【００１１】以降は省略されています）

関連特許